Histone H2B Ubiquitylation Promotes Activity of the Intact Set1 Histone Methyltransferase Complex in Fission Yeast
Notice bibliographique
Résumé
The methylation of histone H3 at lysine 4 (H3K4me) is critical for the formation of transcriptionally active chromatin in eukaryotes. In yeast, Drosophila, and some human cell lines, H3K4me is globally stimulated by the monoubiquitylation of histone H2B (H2Bub1), another histone modification associated with transcription. The mechanism of this "trans-histone" modification pathway remains uncertain, and studies carried out in different experimental systems have suggested that H2Bub1 could either influence the subunit composition of methyltransferase complexes or directly stimulate methyltransferase activity. We have reconstituted this pathway in vitro using the native H3K4-specific methyltransferase complex Set1C purified from the fission yeast Schizosaccharomyces pombe and chromatin substrates that contain semisynthetic H2Bub1. We found that the activity of S. pombe Set1C toward nucleosomal histone H3 is directly enhanced by H2Bub1 in vitro. Importantly, Set1C purified from cells lacking H2Bub1 retained activity on free histone substrates, suggesting that Set1C remains intact in the absence of H2Bub1. Chromatin immunoprecipitation assays revealed a defect in recruitment of intact Set1C to transcribed chromatin in H2Bub1-deficient mutants. Our data argue that trans-histone crosstalk in S. pombe involves direct enhancement of Set1C methyltransferase activity by H2Bub1 and suggest that this represents a conserved aspect of H2Bub1-H3K4me crosstalk in eukaryotes.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».