Characterization of an<i>Escherichia coli</i>Sulfite Oxidase Homologue Reveals the Role of a Conserved Active Site Cysteine in Assembly and Function
Notice bibliographique
Résumé
We report the biochemical and biophysical characterization of YedYZ, a sulfite oxidase homologue from Escherichia coli. YedY is a soluble catalytic subunit with a twin arginine leader sequence for export to the periplasm by the Tat translocation system. YedY is the only molybdoenzyme so far isolated from E. coli with the Mo-MPT form of the molybdenum cofactor. The electron paramagnetic resonance (EPR) signal of the YedY molybdenum is similar to that of known Mo-MPT containing enzymes, with the exception that only the Mo(IV) --> Mo(V) transition is observed, with a midpoint potential of 132 mV. YedZ is a membrane-intrinsic cytochrome b with six putative transmembrane helices. The single heme b of YedZ has a midpoint potential of -8 mV, determined by EPR spectroscopy of YedZ-enriched membrane preparations. YedY does not associate strongly with YedZ on the cytoplasmic membrane. However, mutation of the YedY active site Cys102 to Ser results in very efficient targeting of YedY to YedZ in the membrane, demonstrating a clear role for YedZ as the membrane anchor for YedY. Together, YedYZ comprise a well-conserved bacterial heme-molybdoenzyme found in a variety of bacteria that can be assigned to the sulfite oxidase class of enzyme.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».