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Enregistrement W2079048225 · doi:10.1139/v08-047

Targeted engineering of <i>Cupriavidus necator</i> chromosome for biosynthesis of poly(3-hydroxybutyrate-<i>co</i>-3-hydroxyhexanoate) from vegetable oil

2008· article· en· W2079048225 sur OpenAlexfundvenueno aff
Jun Mifune, Satoshi Nakamura, Toshiaki Fukui

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Chemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMaterials Science
Thématiquebiodegradable polymer synthesis and properties
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesStaatssekretariat für Bildung, Forschung und InnovationPublic Health Agency of Canada
Mots-clésCupriavidus necatorChemistryPolyhydroxybutyrateOperonPolyhydroxyalkanoatesBiochemistryBiosynthesisMutantStrain (injury)EnzymeGeneBacteriaBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Previous studies have demonstrated that heterologous expression of PHA synthase from Aeromonas caviae (PhaCAc), capable of accepting (R)-3-hydroxyacyl-CoA of C4–C7 as substrates, could confer the ability to PHA-negative mutant of Cupriavidus necator PHB-4 to synthesize poly((R)-3-hydroxybutyrate-co-(R)-3-hydroxyhexanoate) [P(3HB-co-3HHx)] from vegetable oils. The mutation point within pha operon in PHB-4 was determined to be a single nonsense mutation within the PHA synthase gene (phaCCn), suggesting the much lower β-ketothiolase and NADPH-dependent acetoacetyl-CoA reductase activities observed in this strain would be a polar effect of the mutation. For further efficient biosynthesis of P(3HB-co-3HHx) copolyester, C. necator wild strain H16 was engineered by homologous recombination targeting the chromosomal phaCCn, and the PHA productivity was compared with previous PHB–4-derived strain harboring phaCAc on a multi-copy plasmid (PHB–4/pJRDEE32d13). A strain H16CAc, in which phaCCn was substituted for phaCAc on the chromosome, could produce P(3HB-co-3HHx) from soybean oil with high productivity, but the 3HHx fraction in the accumulated polymer was decreased. Meanwhile, H16ΔC/pJRDEE32d13, that lost region for the original synthase gene and expresses exochromosomal phaCAc, grew and accumulated PHA with similar properties to the PHB–4-derived strain. The results of enzyme assay suggested that low β-ketothiolase activity might be relevant for decrease of growth ability accompanied by increase of 3HHx composition when soybean oil was fed as a sole carbon source. Key words: poly(hydroxyalkanoates), poly(3-hydroxybutyrate-co-3-hydroxyhexanoate), PHA synthase, Cupriavidus necator, vegetable oil.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,184
Écart entre enseignants0,171 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations66
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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