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Enregistrement W2079473070 · doi:10.1080/03079450600920976

Avian hepatitis E virus in an outbreak of hepatitis–splenomegaly syndrome and fatty liver haemorrhage syndrome in two flaxseed-fed layer flocks in Ontario

2006· article· en· W2079473070 sur OpenAlexaffabout
Agnes Agunos, Dongwan Yoo, Sameh A. Youssef, Brian Binnington, Douglas B. Hunter

Notice bibliographique

RevueAvian Pathology · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis Viruses Studies and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésFlockBiologyHepatitisVirologyFatty liverVirusSpleenDuck hepatitis B virusHepatitis EHepatitis B virusInternal medicineImmunologyMedicineHepadnaviridaeGenotypeDiseaseGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Two commercial layer chicken flocks that were fed a flax-based diet beginning at 28 weeks of age for the production of omega-3 fatty-acid-enriched eggs experienced increased mortality when the birds reached 37 weeks. The average weekly mortality was 0.34% over a 20-week period, with peak mortality of 0.9% for 1 week. Reduced feed consumption, reduced body weight gain and poor peak production were noticed prior to the onset of increased mortality. A total of 245 birds were necropsied and 78% of these had lesions in the liver and spleen, with 44% of those necropsied having changes consistent with hepatitis–splenomegaly syndrome, with lesions ranging from acute periportal lymphoplasmacytic hepatitis to chronic severe cholangiohepatitis with haemorrhage, vasculitis and amyloidosis. A total of 11% of the birds had lesions typical of fatty liver haemorrhagic syndrome, and 22% had lesions found in both hepatitis–splenomegaly syndrome and fatty liver haemorrhagic syndrome. No significant bacteria or viruses were recovered from samples of the liver/bile or spleen but 11 of 21 bile samples contained avian hepatitis E virus RNA detectable with a reverse transcriptase-polymerase chain reaction assay. Comparative sequence analysis found identities of 82 to 92% and 78 to 80% between the helicase and capsid protein genes, respectively, of the virus detected in this outbreak and those of other avian hepatitis E virus isolates, suggesting extensive genetic heterogeneity in avian hepatitis E viruses in Ontario flocks. Deux troupeaux de poules pondeuses commerciales ont été nourris avec un aliment à base de lin à partir de l'âge de 28 semaines pour la production d'œufs enrichis en acide gras omega-3. La mortalité a augmenté quand les animaux atteignaient l'âge de 37 semaines. La mortalité moyenne hebdomadaire a été de 0,34% sur une période de 20 semaines, avec un pic de mortalité de 0,9% durant une semaine. Avant le début de l'augmentation de la mortalité il a été remarqué une diminution de la consommation, une diminution du gain de poids du corps et un pic de production médiocre. Deux cent quarante cinq animaux ont été autopsiés et 78% d'entre eux ont présenté des lésions du foie et de la rate, dont 44% qui avaient des lésions compatibles avec un syndrome de splénomégalie hépatite (HSS), avec des lésions allant d'une hépatite lymphoplasmatique périportale aiguës à une cholangiohépatite chronique grave avec hémorragie, des lésions de vascularite et d'amyloïdose. Onze pourcent de ces animaux avaient des lésions typiques du syndrome foie gras hémorragique (FLHS) et 22% avaient des lésions correspondant à la fois au HSS et au FLHS. Aucun virus ni bactéries importants n'ont été isolés des échantillons de foie/bile ou de rate mais 11 des 21 échantillons de bile contenaient l'ARN du virus de l'hépatite E (HEV) détecté par RT-PCR. L'analyse comparative des séquences des gènes de la protéine de l'hélicase et de la protéine de la capside du virus détecté dans ce cas a montré respectivement 82-92% et 78-80% d'identité avec les autres souches d'HEV aviaires, suggérant une hétérogénéité génétique très grande des HEVs aviaires dans les troupeaux en Ontario. Zwei kommerzielle Legehennenherden, die zur Produktion von Omega-3-Fettsäure-reichen Eiern ab der 28. Lebenswoche ein auf Flachssaat basierendes Futter erhielten, zeigten bis zum Alter von 37 Wochen eine erhöhte Mortalitätsrate. Die durchschnittliche wöchentliche Mortalität betrug über einen Zeitraum von 20 Wochen 0,34%, wobei in einer Woche ein Peak von 0,9% erreicht wurde. Vor dem Auftreten der erhöhten Verluste wurden eine schlechtere Futterverwertung, geringere Gewichtszunahmen und ein Nichterreichen des Leistungshöhepunkts festgestellt. Insgesamt wurden 245 Tiere seziert. Davon wiesen 78% Leber- und Milzveränderungen auf, die bei 44% denjenigen beim Hepatitis-Splenomegalie-Syndrom (HSS) entsprachen mit Läsionen, die von einer akuten periportalen lymphoplasmatischen Hepatitis bis hin zu einer hochgradigen chronischen Cholangiohepatitis mit Hämorrhagien, Vasculitis und Amyloidose reichten. 11% der Tiere hatten Veränderungen, die typisch für das hämorrhagische Fettlebersyndrom (FLHS) waren und 22% der Legehennen zeigten Veränderungen, die sowohl beim HSS als auch beim FLHS zu finden sind. In den Leber- und Galleproben konnten keine pathogenen Bakterien oder Viren isoliert werden, aber mittels Reverse Transkriptase-Polymerasekettenreaktion wurde in 11 von 21 Galleproben RNS des aviären Hepatitis E-Virus (HEV) nachgewiesen. Vergleichende Sequenzanalysen ließen eine 82–92%ige Übereinstimmung zwischen der Helicase und eine 78–80%ige Übereinstimmung zwischen den Kapsidproteingenen des bei diesem Ausbruch entdeckten Virus und denen von anderen aviären HEV-Isolaten erkennen. Dies läßt auf eine erhebliche genetische Heterogenität bei den aviären HEVs in Hühnerbeständen in Ontario schließen. Dos lotes comerciales de gallinas ponedoras que fueron alimentadas con una dieta basada en lino desde las 28 semanas de vida para la producción de huevos enriquecidos con ácidos grasos omega-3 sufrieron un incremento de mortalidad cuando las aves llegaron a las 37 semanas. La mortalidad media semanal fue del 0.34% a las 20 semanas con un pico de mortalidad del 0.9% en una semana. Previamente al inicio del incremento de mortalidad se apreció una reducción del consumo de pienso y del peso corporal y un pico de producción pobre. Se necropsiaron un total de 245 aves y el 78% de éstas tenían lesiones en el hígado y bazo, y un 44% de las necropsiadas tenía cambios compatibles con el síndrome de hepatitis-esplenomegalia (HSS), con lesiones que variaban entre la hepatitis linfoplasmocitaria periportal a la colangiohepatitis crónica grave con hemorragia, vasculitis y amiloidosis. Un 11% de las aves tenía lesiones características del síndrome hemorrágico del hígado graso (FLHS) y un 22% tenía lesiones que se han encontrado en ambos HSS y FLHS. No se aislaron bacterias ni virus significativos de las muestras de hígado/bilis o bazo, pero 11 de las 21 muestras de bilis contenían RNA del virus de la hepatitis B aviar detectado mediante la prueba de la reacción en cadena de la polimerasa-transcriptasa. Los análisis comparativos de secuencias encontraron similitudes del 82-92% y del 78-80% entre los genes de la helicasa y de la proteína de la cápside, respectivamente, de los virus detectados en este brote y los de otros aislamientos de HEV aviares, lo cual sugiere una heterogeneidad genética extensa en los HEV de los lotes de Ontario.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,444
Score d'incertitude au seuil0,893

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0020,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2006
Routes d'admission2
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