Synthesis and degradation of dinoflagellate plastid-encoded psbA proteins are light-regulated, not circadian-regulated
Notice bibliographique
Résumé
In many dinoflagellate species, the plastid genome has been proposed to exist as a limited number of single-gene minicircles, and many genes normally found in the plastid genome are nuclear-encoded. Unlike the nuclear-encoded plastid-directed gene products whose expression is often regulated by the circadian clock, little is known about expression of minicircle genes. Furthermore, even the plastid location of the minicircles has recently been challenged. We have examined the incorporation in vivo of [(35)S]methionine into the proteins of purified plastids, and we find that several plastid proteins are labeled in the presence of cycloheximide but not chloramphenicol. One of these proteins, labeled in two different dinoflagellate species, was identified as psbA by Western blot analysis. Furthermore, this psbA has the expected physiological characteristics, because both synthesis and degradation are induced by light. We find no evidence for circadian control over either synthesis or degradation of psbA, unlike the several nuclear-encoded plastid-directed proteins studied. Finally, we find that levels of psbA protein or RNA do not change over a 24-h light-dark cycle, suggesting that this protein may not be involved in mediating the circadian rhythm in oxygen evolution rates. This demonstration is the first, to our knowledge, that minicircle genes encoding plastid proteins are translated in dinoflagellate plastids, and it suggests that a proteomic approach to characterizing the dinoflagellate plastid genome is feasible.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».