β‐Catenin (<i>CTNNB1</i>) gene amplification: A new mechanism of protein overexpression in cancer
Notice bibliographique
Résumé
beta-Catenin nuclear translocation is frequently observed in different types of malignancies, including gastric cancer. In gastric cancer, however, the molecular mechanisms leading to accumulation of this protein in the nucleus remain unknown. In this setting, beta-catenin (CTNNB1) mutations have been reported, but studies of mutation frequency have yielded conflicting results. Mutations or silencing of other partners of beta-catenin (i.e., APC and AXIN) are also considered rare genetic events in gastric tumorigenesis. Gene amplification is a common mechanism of activation and/or overexpression of oncogenes in gastric and other cancers. In this study, we investigated whether gene amplification is a possible mechanism of beta-catenin activation in gastric cancer by determining its presence in 49 patients with gastric cancer and two gastric-derived cell lines (KATO III and ST2957). Using fluorescence in situ hybridization, we identified beta-catenin amplification in one of the tumor samples as well as in KATO III cells. beta-Catenin immunostaining revealed nuclear translocation of the protein in both cases. In the KATO III cells, beta-catenin overexpression was confirmed by quantitative real-time PCR and Western blot analyses and beta-catenin gene amplification by Southern blot analysis and multiplex ligation probe amplification. In the KATO III cell line, no correlation was found between beta-catenin nuclear translocation and increased expression of the WNT1 target gene CCND1 (cyclin D1). Our data suggest that gene amplification is a possible mechanism of beta-catenin overexpression in cancer.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».