On the Stability of Double Stranded Nucleic Acids
Notice bibliographique
Résumé
We present the first pressure-versus-temperature phase diagram for the helix-to-coil transition of double stranded nucleic acids. The thermodynamic stability of a nucleic acid duplex is a complex function of temperature and pressure and strongly depends on the denaturation temperature, T(M), of the duplex at atmospheric pressure. Depending upon T(M), pressure, and temperature, the phase diagram shows that pressure may stabilize, destabilize, or have no effect on the conformational state of DNA. To verify the phase diagram, we have conducted high-pressure UV melting experiments on poly(dIdC)poly(dIdC), a DNA duplex, poly(rA)poly(rU), an RNA duplex, and poly(dA)poly(rU), a DNA/RNA hybrid duplex. The T(M) values of these duplexes have been modulated by altering the solution ionic strength. Significantly, at low salt, these three duplexes have helix-to-coil transition temperatures of 50 degrees C or less. In agreement with the derived phase diagram, we found that the polymeric duplexes were destabilized by pressure if the T(M) is < approximately 50 degrees C. However, these duplexes were stabilized by pressure if the T(M) is > approximately 50 degrees C. The DNA/RNA hybrid duplex, poly(dA)poly(rU), with a T(M) of 31 degrees C in 20 mM NaCl undergoes a pressure-induced helix-to-coil transition at room temperature. This is the first report of pressure-induced denaturation of a nucleic acid duplex and provides new insights into the molecular forces stabilizing these structures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».