Roles of Salt and Conformation in the Biological and Physicochemical Behavior of Protegrin-1 and Designed Analogues: Correlation of Antimicrobial, Hemolytic, and Lipid Bilayer-Perturbing Activities
Notice bibliographique
Résumé
Protegrins are short (16-18 residues) cationic peptides from porcine leukocytes that display potent, broad-spectrum antimicrobial activity. Protegrin-1 (PG-1), one of five natural homologues, adopts a rigid beta-hairpin structure that is stabilized by two disulfide bonds. We have previously employed the principles of beta-hairpin design to develop PG-1 variants that lack disulfide bonds but nevertheless display potent antimicrobial activity [Lai, J. R., Huck, B. R., Weisblum, B., and Gellman, S. H. (2002) Biochemistry 41, 12835-12842.]. The activity of these disulfide-free variants, however, is attenuated in the presence of salt, and the activity of PG-1 itself is not. Salt-induced inactivation of host-defense peptides, such as human defensins, is thought to be important in some pathological situations (e.g., cystic fibrosis), and the variation in salt-sensitivity among our PG-1 analogues offers a model system with which to explore the origins of these salt effects. We find that the variations in antimicrobial activity among our peptides are correlated with the folding propensities of these molecules and with the extent to which the peptides induce leakage of contents from synthetic liposomes. Comparable correlations were observed between folding and hemolytic activity. The extent to which added salt reduces antimicrobial activity parallels salt effects on vesicle perturbation, which suggests that the biological effects of high salt concentrations arise from modulation of peptide-membrane interactions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».