Plastid-localized amino acid biosynthetic pathways of Plantae are predominantly composed of non-cyanobacterial enzymes
Notice bibliographique
Résumé
Studies of photosynthetic eukaryotes have revealed that the evolution of plastids from cyanobacteria involved the recruitment of non-cyanobacterial proteins. Our phylogenetic survey of >100 Arabidopsis nuclear-encoded plastid enzymes involved in amino acid biosynthesis identified only 21 unambiguous cyanobacterial-derived proteins. Some of the several non-cyanobacterial plastid enzymes have a shared phylogenetic origin in the three Plantae lineages. We hypothesize that during the evolution of plastids some enzymes encoded in the host nuclear genome were mistargeted into the plastid. Then, the activity of those foreign enzymes was sustained by both the plastid metabolites and interactions with the native cyanobacterial enzymes. Some of the novel enzymatic activities were favored by selective compartmentation of additional complementary enzymes. The mosaic phylogenetic composition of the plastid amino acid biosynthetic pathways and the reduced number of plastid-encoded proteins of non-cyanobacterial origin suggest that enzyme recruitment underlies the recompartmentation of metabolic routes during the evolution of plastids.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».