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Enregistrement W2080992095 · doi:10.4161/rna.4.3.5170

A Minimal WLE2 Element is Not Sufficient to Direct Apical Localization in the Absence of RNAs Containing the Full Length Wingless 3'UTR

2007· article· en· W2080992095 sur OpenAlexaff
Nima Najand, Andrew Simmonds

Notice bibliographique

RevueRNA Biology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyRNAUntranslated regionCytoplasmCell biologyThree prime untranslated regionGeneticsMolecular biologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The mRNAs encoded by the Drosophila Wnt-1 homologue, wingless, are localized to a small region of the apical cytoplasm in early embryonic epithelial cells. This requires the activity of cis-acting sequences within the 3' untranslated region called wingless localization elements (WLEs). One of these, WLE2, was identified initially as a cis-acting sequence that directed apical localization of in vivo expressed mRNAs in four to five hour Drosophila embryos. To determine the precise activity of WLE2 during wingless apical localization, we performed an in-depth mutagenesis of this sequence. Using both direct-injection and in vivo transgenes we determined that WLE2, by itself, is not sufficient to direct binding of trans-acting factors that mediate apical RNA transport in embryonic cells. Rather, RNAs containing only WLE2 are transported apically only in the presence of a second RNA containing other cis-acting localization sequences of the wingless 3' untranslated region. This co-requirement for WLE2 and additional wingless 3'UTR sequences is likely a required function during apical localization, as mutations within WLE2 can modify the apical localization activity of RNA molecules that contain other wingless localization signals. This suggests that, similar to other localized mRNAs like bicoid, wingless localization may require specific RNA-RNA interactions as well as recognition by cytoplasmic RNA localization complexes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,071
Score d'incertitude au seuil0,248

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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