MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2081047047 · doi:10.1371/journal.pone.0119920

Inherited Variation at MC1R and Histological Characteristics of Primary Melanoma

2015· article· en· W2081047047 sur OpenAlexafffundabout
Nicholas Taylor, Klaus J. Busam, Lynn From, Pamela A. Groben, Hoda Anton‐Culver, Anne Ε. Cust, Colin B. Begg, Terence Dwyer, Richard P. Gallagher, Stephen B. Gruber, Irene Orlow, Stefano Rosso, Nancy E. Thomas, Roberto Zanetti, Timothy R. Rebbeck, Marianne Berwick, Peter A. Kanetsky

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCutaneous Melanoma Detection and Management
Établissements canadiensBC Cancer AgencyWomen's College Hospital
Organismes subventionnairesUniversity of California, IrvineUniversity of North Carolina at Chapel HillMissouri Department of Health and Senior ServicesMenzies Institute for Medical ResearchUniversity of SydneyUniversity of TasmaniaMichael Smith Health Research BCNational Institute of Environmental Health SciencesMemorial Sloan-Kettering Cancer CenterCancer Council NSWMenzies Research Institute TasmaniaCancer Care OntarioUniversity of PennsylvaniaNational Cancer InstituteState of New Jersey Department of HealthUniversity of Southern California
Mots-clésMelanomaMelanocortin 1 receptorMedicineBreslow ThicknessNonsynonymous substitutionVemurafenibCancerGenotypeEye colorPathologyDermatologyPhenotypeInternal medicineOncologyBiologyGeneticsGeneBreast cancerCancer research

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Variation in the melanocortin-1receptor (MC1R) gene is associated with pigmentary phenotypes and risk of malignant melanoma. Few studies have reported on MC1R variation with respect to tumor characteristics, especially clinically important prognostic features. We examined associations between MC1R variants and histopathological melanoma characteristics. Study participants were enrolled from nine geographic regions in Australia, Canada, Italy and the United States and were genotyped for MC1R variants classified as high-risk [R] (D84E, R142H, R151C, R160W, and D294H, all nonsense and insertion/deletion) or low-risk [r] (all other nonsynonymous) variants. Tissue was available for 2,160 white participants of the Genes, Environment and Melanoma (GEM) Study with a first incident primary melanoma diagnosis, and underwent centralized pathologic review. No statistically significant associations were observed between MC1R variants and AJCC established prognostic tumor characteristics: Breslow thickness, presence of mitoses or presence of ulceration. However, MC1R was significantly associated with anatomic site of melanoma (p = 0.002) and a positive association was observed between carriage of more than one [R] variant and melanomas arising on the arms (OR = 2.39; 95% CI: 1.40, 4.09). We also observed statistically significant differences between sun-sensitive and sun-resistant individuals with respect to associations between MC1R genotype and AJCC prognostic tumor characteristics. Our results suggest inherited variation in MC1R may play an influential role in anatomic site presentation of melanomas and may differ with respect to skin pigmentation phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,818
Score d'incertitude au seuil0,220

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,225
Écart entre enseignants0,159 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2015
Routes d'admission3
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetCutaneous Melanoma Detection and ManagementTravaux en français237 207