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Enregistrement W2081411799 · doi:10.1210/me.2008-0188

Structure and Activity of the Human Growth Hormone Receptor (<i>hGHR</i>) Gene V2 Promoter

2008· article· en· W2081411799 sur OpenAlexaff
Yuhong Wei, Svetlana Puzhko, Martin Wabitsch, Cynthia G. Goodyer

Notice bibliographique

RevueMolecular Endocrinology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGrowth Hormone and Insulin-like Growth Factors
Établissements canadiensMcGill University Health CentreMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyAlternative splicingGenePromoterGene isoformGrowth hormone receptorHousekeeping geneExonTranscription (linguistics)5' flanking regionMolecular biologyGeneticsGene expressionGrowth hormoneEndocrinology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Human GH (hGH) has important effects on growth as well as carbohydrate, fat, and protein metabolism. These actions require the presence of normal levels of a functional hGH receptor (hGHR) on the surface of target cells. hGHR gene expression is characterized by the use of several 5'-noncoding exons and alternative splicing, resulting in the generation of multiple mRNA isoforms. The hGHR V2 transcript is predominant in most tissues, including human fat. However, factors regulating its ubiquitous expression have remained unidentified. The present study was aimed at characterizing the mechanisms regulating hGHR V2 transcription. Two major V2 transcriptional start sites were identified by primer extension assays. The V2 proximal promoter is TATA-less, with several characteristics of a housekeeping gene promoter. Transient transfection analyses of 2.6 kb of the 5'-flanking region of V2 confirmed its promoter activity in multiple primate cell lines. Similar promoter activity patterns were observed in human SGBS preadipocytes and mature adipocytes but with much higher V2 promoter activity in mature adipocytes, suggesting that changes in the availability of specific factors during adipocyte differentiation play a role in V2 promoter regulation. Serial deletion and mutation analyses revealed that transcription of hGHR V2 in different cell types, including adipocytes, is determined by a core promoter and distinct inhibitory and activation domains in the 5'-promoter region as well as within the V2 exon. Our data suggest that V2 transcription is the result of a complex interplay involving multiple factors, to ensure appropriate expression of hGHR in different hGH target cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,241
Score d'incertitude au seuil0,735

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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