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Enregistrement W2081575623 · doi:10.1371/journal.pone.0090024

Regulation of hERG and hEAG Channels by Src and by SHP-1 Tyrosine Phosphatase via an ITIM Region in the Cyclic Nucleotide Binding Domain

2014· article· en· W2081575623 sur OpenAlexafffund
Lyanne C. Schlichter, Jiahua Jiang, John Wang, Evan W. Newell, Florence W. L. Tsui, Doris Lam

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity Health NetworkUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeCanadian Institutes of Health ResearchNational Science Foundation
Mots-cléshERGProtein tyrosine phosphataseSH2 domainProto-oncogene tyrosine-protein kinase SrcReceptor tyrosine kinaseTyrosine phosphorylationPhosphorylationTyrosineTyrosine kinasePhosphataseCell biologyBiologyChemistryBiochemistrySignal transductionPotassium channelBiophysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Members of the EAG K(+) channel superfamily (EAG/Kv10.x, ERG/Kv11.x, ELK/Kv12.x subfamilies) are expressed in many cells and tissues. In particular, two prototypes, EAG1/Kv10.1/KCNH1 and ERG1/Kv11.1/KCNH2 contribute to both normal and pathological functions. Proliferation of numerous cancer cells depends on hEAG1, and in some cases, hERG. hERG is best known for contributing to the cardiac action potential, and for numerous channel mutations that underlie 'long-QT syndrome'. Many cells, particularly cancer cells, express Src-family tyrosine kinases and SHP tyrosine phosphatases; and an imbalance in tyrosine phosphorylation can lead to malignancies, autoimmune diseases, and inflammatory disorders. Ion channel contributions to cell functions are governed, to a large degree, by post-translational modulation, especially phosphorylation. However, almost nothing is known about roles of specific tyrosine kinases and phosphatases in regulating K(+) channels in the EAG superfamily. First, we show that tyrosine kinase inhibitor, PP1, and the selective Src inhibitory peptide, Src40-58, reduce the hERG current amplitude, without altering its voltage dependence or kinetics. PP1 similarly reduces the hEAG1 current. Surprisingly, an 'immuno-receptor tyrosine inhibitory motif' (ITIM) is present within the cyclic nucleotide binding domain of all EAG-superfamily members, and is conserved in the human, rat and mouse sequences. When tyrosine phosphorylated, this ITIM directly bound to and activated SHP-1 tyrosine phosphatase (PTP-1C/PTPN6/HCP); the first report that a portion of an ion channel is a binding site and activator of a tyrosine phosphatase. Both hERG and hEAG1 currents were decreased by applying active recombinant SHP-1, and increased by the inhibitory substrate-trapping SHP-1 mutant. Thus, hERG and hEAG1 currents are regulated by activated SHP-1, in a manner opposite to their regulation by Src. Given the widespread distribution of these channels, Src and SHP-1, this work has broad implications in cell signaling that controls survival, proliferation, differentiation, and other ERG1 and EAG1 functions in many cell types.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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