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Enregistrement W2082756994 · doi:10.1182/blood-2010-06-291237

Functional roles of aspartate residues of the proton-coupled folate transporter (PCFT-SLC46A1); a D156Y mutation causing hereditary folate malabsorption

2010· article· en· W2082756994 sur OpenAlexaff
Daniel Sanghoon Shin, Sang Hee Min, Laura Russell, Rongbao Zhao, András Fiser, I. David Goldman

Notice bibliographique

RevueBlood · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueFolate and B Vitamins Research
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Children's Hospital
Organismes subventionnairesNational Cancer Institute
Mots-clésMutationFolic acidGeneticsTransporterMalabsorptionMethylenetetrahydrofolate reductaseMedicineBiologyChemistryBiochemistryInternal medicineGeneAllele

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The proton-coupled folate transporter (PCFT; SLC46A1) mediates folate transport into enterocytes in the proximal small intestine; pcft loss-of-function mutations are the basis for hereditary folate malabsorption. The current study explored the roles of Asp residues in PCFT function. A novel, homozygous, loss-of-function mutation, D156Y, was identified in a child of Pakistani origin with hereditary folate malabsorption. Of the 6 other conserved Asp residues, only one, D109, is shown to be required for function. D156Y, along with a variety of other substitutions at this site (Trp, Phe, Val, Asn, or Lys), lacked function due to instability of the PCFT protein. Substantial function was preserved with Glu, Gly, and, to a lesser extent, with Ser, Thr, and Ala substitutions. This correlated with PCFT bio-tinylated at the cell surface. In contrast, all D109 mutants, including D109E, lacked function irrespective of pH (4.5, 5.5, and 7.4) or substrate concentration (0.5-100 μM), despite surface expression comparable to wild-type PCFT. Hence, D156 plays a critical role in PCFT protein stability, and D109, located in the first intracellular loop between the second and third transmembrane domains, is absolutely required for PCFT function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,446
Score d'incertitude au seuil0,436

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,262
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations53
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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