Developmental stage–specific epigenetic control of human β-globin gene expression is potentiated in hematopoietic progenitor cells prior to their transcriptional activation
Notice bibliographique
Résumé
To study epigenetic regulation of the human beta-globin locus during hematopoiesis, we investigated patterns of histone modification and chromatin accessibility along this locus in hematopoietic progenitor cells (HPCs) derived from both humans and transgenic mice. We demonstrate that the developmentally related activation of human beta-like globin genes in humans and transgenic mice HPCs is preceded by a wave of gene-specific histone H3 hyperacetylation and K4 dimethylation. In erythroid cells, expression of beta-like globin genes is associated with histone hyperacetylation along these genes and, surprisingly, with local deacetylation at active promoters. We also show that endogenous mouse beta major and human beta-like genes are subject to different epigenetic control mechanisms in HPCs. This difference is likely due to intrinsic properties of the human beta-globin locus since, in transgenic mice, this locus is epigenetically regulated in the same manner as in human HPCs. Our results suggest that a defined pattern of histone H3 acetylation/dimethylation is important for specific activation of human globin promoters during development in human and transgenic HPCs. We propose that this transient acetylation/dimethylation is involved in gene-specific potentiation in HPCs (ie, before extensive chromatin remodeling and transcription take place in erythroid cells).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».