A Functional Phenylacetic Acid Catabolic Pathway Is Required for Full Pathogenicity of <i>Burkholderia cenocepacia</i> in the <i>Caenorhabditis elegans</i> Host Model
Notice bibliographique
Résumé
Burkholderia cenocepacia is a member of the Burkholderia cepacia complex, a group of metabolically versatile bacteria that have emerged as opportunistic pathogens in cystic fibrosis and immunocompromised patients. Previously a screen of transposon mutants in a rat pulmonary infection model identified an attenuated mutant with an insertion in paaE, a gene related to the phenylacetic acid (PA) catabolic pathway. In this study, we characterized gene clusters involved in the PA degradation pathway of B. cenocepacia K56-2 in relation to its pathogenicity in the Caenorhabditis elegans model of infection. We demonstrated that targeted-insertion mutagenesis of paaA and paaE, which encode part of the putative PA-coenzyme A (CoA) ring hydroxylation system, paaZ, coding for a putative ring opening enzyme, and paaF, encoding part of the putative beta-oxidation system, severely reduces growth on PA as a sole carbon source. paaA and paaE insertional mutants were attenuated for virulence, and expression of paaE in trans restored pathogenicity of the paaE mutant to wild-type levels. Interruption of paaZ and paaF slightly increased virulence. Using gene interference by ingested double-stranded RNA, we showed that the attenuated phenotype of the paaA and paaE mutants is dependent on a functional p38 mitogen-activated protein kinase pathway in C. elegans. Taken together, our results demonstrate that B. cenocepacia possesses a functional PA degradation pathway and that the putative PA-CoA ring hydroxylation system is required for full pathogenicity in C. elegans.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».