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Enregistrement W2083241637 · doi:10.1074/jbc.m409579200

The Nuclear Tyrosine Kinase BRK/Sik Phosphorylates and Inhibits the RNA-binding Activities of the Sam68-like Mammalian Proteins SLM-1 and SLM-2

2004· article· en· W2083241637 sur OpenAlexaff
Andrea Haegebarth, Darien Heap, Wenjun Bie, Jason Derry, Stéphane Richard, Angela L. Tyner

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases
Mots-clésRNA-binding proteinPhosphorylationRNAGene expressionCell biologyRNA splicingMessenger RNAKinaseBiologyChemistryBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Expression of the intracellular tyrosine kinase BRK/Sik is epithelial-specific and regulated during differentiation. Only a few substrates have been identified for BRK/Sik, including the KH domain containing RNA-binding protein Sam68 and the novel adaptor protein BKS. Although the physiological role of Sam68 is unknown, it has been shown to regulate mRNA transport, pre-mRNA splicing, and polyadenylation. Here we demonstrate that the Sam68-like mammalian proteins SLM-1 and SLM-2 but not the related KH domain containing heterogeneous nuclear ribonucleoprotein K are novel substrates of BRK/Sik. The expression of active BRK/Sik results in increased SLM-1 and SLM-2 phosphorylation and increased retention of BRK/Sik within the nucleus. The phosphorylation of SLM-1 and SLM-2 has functional relevance and leads to inhibition of their RNA-binding abilities. We show that SLM-1, SLM-2, and BRK/Sik have restricted patterns of expression unlike the ubiquitously expressed Sam68. Moreover, BRK/Sik, SLM-1, and Sam68 transcripts were coexpressed in the mouse gastrointestinal tract and skin, suggesting that SLM-1 and Sam68 could be physiologically relevant BRK/Sik targets in vivo. The ability of BRK/Sik to negatively regulate the RNA-binding activities of the KH domain RNA binding proteins SLM-1 and Sam68 may have an impact on the posttranscriptional regulation of epithelial cell gene expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,257

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations81
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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