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Enregistrement W2083486056 · doi:10.1002/mas.10081

Investigation of intact protein complexes by mass spectrometry

2004· review· en· W2083486056 sur OpenAlexfundno aff
Albert J. R. Heck, Robert H. H. van den Heuvel

Notice bibliographique

RevueMass Spectrometry Reviews · 2004
Typereview
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSandia National LaboratoriesUniversità degli Studi di PaviaWageningen University and ResearchUniversiteit UtrechtSyddansk UniversitetUniversity of CambridgeUniversiteit van AmsterdamUniversity of WarwickUniversity of Alberta
Mots-clésChemistryMass spectrometryCooperativityElectrospray ionizationCofactorCovalent bondProtein subunitNanotechnologyProteomicsComputational biologyChromatographyBiochemistryOrganic chemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract I. Introduction 00 II. Electrospray Ionization of Biomacromolecules 00 III. Mass Analyzers for Biomacromolecular Mass Spectrometry 00 A. Collisional Cooling and/or Focusing 00 B. Alternative Mass Analyzers 00 IV. Solution‐Phase Properties of Proteins Complexes 00 A. Protein–Protein Interactions 00 B. Cooperativity and Cofactors 00 C. Dynamics of Assembly 00 V. Gas‐Phase Properties of Protein Complexes 00 A. Tandem Mass Spectrometry 00 B. Charge Separation in Protein Dissociation 00 VI. Future Outlook 00 Acknowledgments 00 References 00 Mass spectrometry has grown in recent years to a well‐accepted and increasingly important complementary technique in structural biology. Especially electrospray ionization mass spectrometry is well suited for the detection of non‐covalent protein complexes and their interactions with DNA, RNA, ligands, and cofactors. Over the last decade, significant advances have been made in the ionization and mass analysis techniques, which makes the investigation of even larger and more heterogeneous intact assemblies feasible. These technological developments have paved the way to study intact non‐covalent protein–protein interactions, assembly and disassembly in real time, subunit exchange, cooperativity effects, and effects of cofactors, allowing us a better understanding of proteins in cellular processes. In this review, we describe some of the latest developments and several highlights. © 2004 Wiley Periodicals, Inc., Mass Spec Rev

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,006

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,052
Tête enseignante GPT0,318
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations583
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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