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Enregistrement W2083733102 · doi:10.1021/ac5029962

In Vitro Selection of a New Lanthanide-Dependent DNAzyme for Ratiometric Sensing Lanthanides

2014· article· en· W2083733102 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueAnalytical Chemistry · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesOntario Ministry of Research and InnovationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOntario Ministry of Research, Innovation and Science
Mots-clésChemistryLanthanideDeoxyribozymeSelection (genetic algorithm)In vitroCombinatorial chemistryEnvironmental chemistryNanotechnologyBiochemistryOrganic chemistryDNAIon

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Developing biosensors for lanthanides is an important but challenging analytical task. To address this problem, in vitro selection of RNA-cleaving DNAzymes was carried out using a library containing a region of 35 random nucleotides in the presence of Lu(3+), since Lu(3+) was reported to be the most efficient lanthanide for RNA cleavage. The resulting DNA sequences can be aligned to a single family with two conserved stretches of nucleotides. One of the representative DNAzymes (named Lu12) was further studied. Lu12 is more active with smaller lanthanides and has the lowest activity in the presence of the largest lanthanide (lutetium). Its cleavage rate is 0.12 min(-1) in the presence of 10 μM Nd(3+) at pH 6.0. This is a new DNAzyme, and a catalytic beacon sensor is designed by attaching a fluorophore/quencher pair, detecting Nd(3+) down to 0.4 nM (72 parts-per-trillion). This DNAzyme is highly selective for lanthanides as well, showing cleavage only with two nonlanthanide ions: Y(3+) and Pb(2+). We previously reported a DNAzyme named Ce13d, which has similar responses to all the trivalent lanthanides. Combining these two allows for a ratiometric assay that identifies a few large lanthanides.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,072
Score d'incertitude au seuil0,504

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,285
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle