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Enregistrement W2083801826 · doi:10.1109/bibe.2007.4375553

Cooperative Partitional-Divisive Clustering and Its Application in Gene Expression Analysis

2007· article· en· W2083801826 sur OpenAlexaff
Rasha Kashef, Mohamed S. Kamel

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGene expression and cancer classification
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCluster analysisCorrelation clusteringComputer scienceCURE data clustering algorithmSingle-linkage clusteringData miningConsensus clusteringData stream clusteringCanopy clustering algorithmFuzzy clusteringClustering high-dimensional dataArtificial intelligencePattern recognition (psychology)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clustering techniques organize a collection of objects into cohesive groups called clusters such that objects in the same cluster are more similar to each other than objects in different clusters. There are many clustering approaches proposed in the literature with different quality/complexity tradeoffs. Combining multiple clustering is an approach to overcome the deficiency of single algorithms and further enhance their performances. Current approaches to combining multiple clusterings use end-result cooperation (e.g. ensemble clustering and hybrid clustering) between the clustering algorithms. Inherent drawbacks of the end-result cooperation are: the computational complexity of ensemble clustering and the idle wasted time in the hybrid approaches. In this paper, the k-means and the bisecting k-means clustering algorithms are both combined using intermediate-cooperation strategy for the aim of obtaining better clustering solutions than non-cooperative algorithms. Undertaken experimental results show that the quality of the clustering solutions obtained from the cooperative partitional-divisive clustering (CPDC) model is better than those obtained from the non-cooperative algorithms over a number of gene expression datasets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,215
Score d'incertitude au seuil0,260

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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