Unstable familial transmissions of Huntington disease alleles with 27–35 CAG repeats (intermediate alleles)
Notice bibliographique
Résumé
There are inconsistent reports regarding the likelihood of repeat instability for alleles with 27-35 CAG repeats in the Huntington disease (HD) gene. We have examined the intergenerational stability of such intermediate alleles in 51 families from the University of British Columbia's DNA and Tissue Bank for Huntington Disease Research (UBC-HD Databank). A total of 181 transmissions were identified, with 30% (n = 54/181) of the alleles being unstable upon transmission. The unstable transmissions included both expansions (n = 37) and contractions (n = 17) of CAG size. Of the expanded alleles, 68% (n = 25/37) expanded into the HD range (>36 CAG). Therefore, 14% (n = 25/181) of the 27-35 CAG allele transmissions examined expanded into the disease-associated range resulting in a new mutation for HD. Significantly, of these new mutations, 40% (n = 10/25) originated from an allele with 35 CAG repeats with CAG repeat expansions ranging from +1 CAG to +23 CAG. The proportion of new mutations in the UBC-HD Databank is consistent with the most recent new mutation rate for HD, estimated to be at least 10%. The observed difference in the stability of HD intermediate allele transmissions in this data set and in other studies may be a reflection of a small sample size. Alternately, these inconsistencies may indicate an underlying difference in genetic factors which influence repeat instability between the different populations examined. Additional studies determining the frequency and magnitude of repeat instability in this CAG repeat range and factors that influence instability are urgently needed. Until we understand the clinical implications of HD alleles with 27-35 CAG repeats and establish reliable risks of instability, we should exercise caution when translating these results to the clinic.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».