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Enregistrement W2084302392 · doi:10.1523/jneurosci.4579-07.2008

Separate Proteolipid Protein/DM20 Enhancers Serve Different Lineages and Stages of Development

2008· article· en· W2084302392 sur OpenAlexafffund
M. C. Tuason, A. Rastikerdar, Tanja Kuhlmann, C. Goujet-Zalc, Bernard Zalc, Sérgio Atala Dib, Hana Friedman, AC Peterson

Notice bibliographique

RevueJournal of Neuroscience · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
Thématiqueinterferon and immune responses
Établissements canadiensMcGill UniversityRoyal Victoria Hospital
Organismes subventionnairesInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleGenome Canada
Mots-clésBiologyProteolipid protein 1EnhancerGene isoformGeneticsMyelin proteolipid proteinGeneLocus (genetics)TransgeneOligodendrocytePhenotypeMyelinCell biologyGene expressionMyelin basic proteinCentral nervous systemNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The gene encoding DM20 emerged in cartilaginous fish, descending from a bilaterian ancestor of the M6 proteolipid gene family. Its proteolipid protein (PLP) isoform appeared in amphibians, contains an additional 35 amino acids, and, in the mammalian CNS, is the dominant myelin protein in which it confers an essential neuroprotective function. During development, the DM20 isoform is prominent in a number of tissues, and plp/DM20 transcripts are detected in multiple progenitor populations, including those that continue to express plp/DM20 as they differentiate into myelinating oligodendrocytes. The locus also encodes isoforms with extended leader sequences that accumulate in the cell bodies of several types of neurons. Here, to locate and characterize regulatory sequences controlling the complex plp/DM20 transcription program, putative regulatory sequences, suggested by interspecies conservation, were ligated individually to a minimally promoted eGFPlacZ reporter gene. These constructs were inserted in single copy at a common site adjacent to the hypoxanthine-guanine phosphoribosyltransferase locus in embryonic stem cells and their in vivo expression programs were compared in transgenic mice. Most expressed developmental and cell-specific subprograms accommodated within the known expression phenotype of the endogenous plp/DM20 locus, thus defining multiple components of the combinatorial mechanism controlling its normal temporal and cell-specific program. Along with previously characterized nervous system enhancers, those described here should help expose the content and configuration of elements that are operational in multiple glial and neuronal lineages. The transgenic lines derived here also provide effective markers for multiple stages of glial and neuronal lineage progression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,099
Score d'incertitude au seuil0,331

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations36
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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