Interactions of the HIV-1 Tat and RAP74 Proteins with the RNA Polymerase II CTD Phosphatase FCP1
Notice bibliographique
Résumé
FCP1, a phosphatase specific for the carboxyl-terminal domain of the largest subunit of RNA polymerase II, is regulated by the HIV-1 Tat protein, CK2, TFIIB, and the large subunit of TFIIF (RAP74). We have characterized the interactions of Tat and RAP74 with the BRCT-containing central domain of FCP1 (FCP1(562)(-)(738)). We demonstrated that FCP1 is required for Tat-mediated transactivation in vitro and that amino acids 562-685 of FCP1 are necessary for Tat interaction in yeast two-hybrid studies. From sequence alignments, we identified a conserved acidic/hydrophobic region in FCP1 adjacent to its highly conserved BRCT domain. In vitro binding studies with purified proteins indicate that HIV-1 Tat interacts with both the acidic/hydrophobic region and the BRCT domain of FCP1, whereas RAP74(436)(-)(517) interacts solely with a portion of the acidic/hydrophobic region containing a conserved LXXLL-like motif. HIV-1 Tat inhibits the binding of RAP74(436)(-)(517) to FCP1. In a companion paper (K. Abbott et al. (2005) Enhanced Binding of RNAPII CTD Phosphatase FCP1 to RAP74 Following CK2 Phosphorylation, Biochemistry 44, 2732-2745, we identified a novel CK2 site adjacent to this conserved LXXLL-like motif. Phosphorylation of FCP1(562)(-)(619) by CK2 at this site increases binding to RAP74(436)(-)(517), but this phosphorylation is inhibited by Tat. Our results provide insights into the mechanisms by which Tat inhibits the FCP1 CTD phosphatase activity and by which FCP1 mediates transcriptional activation by Tat. In addition to increasing our understanding of the role of HIV-1 Tat in transcriptional regulation, this study defines a clear role for regions adjacent to the BRCT domain in promoting important protein-protein interactions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».