NoteThe stringent response genes<i>relA</i>and<i>spoT</i>are important for<i>Escherichia coli</i>biofilms under slow-growth conditions
Notice bibliographique
Résumé
In order to see whether the stringent response was involved in biofilm formation, Escherichia coli DS291 (MG1655), and its isogenic relA spoT derivative were grown for 48 h in a chemostat at dilution rates of 0.025 and 0.25 h(-1) under serine limitation. The absence of the stringent response genes relA and spoT had little effect on the planktonic cell concentrations. However, a significant (P < 0.001) reduction in biofilm cell density of the relA spoT mutants was seen at a doubling time of 40 h. At a doubling time of 4 h, differences in biofilm cell density were not significant. Scanning confocal laser microscopy demonstrated the cell densities of microcolonies in the relA spoT mutant to be lower than those in the wild type. Using a microtiter plate assay, we found biofilm formation in relA spoT mutants to be similarly reduced in minimal media but to be enhanced in rich media (Luria-Bertani broth). No significant differences in biofilm formation were observed between wild type and isogenic relA mutants under any growth conditions. Overall, these results suggest that both stringent response genes relA and spoT are important in nutrient-limited biofilms.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,007 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».