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Enregistrement W2085475144 · doi:10.1210/en.2010-0137

OASIS/CREB3L1 Induces Expression of Genes Involved in Extracellular Matrix Production But Not Classical Endoplasmic Reticulum Stress Response Genes in Pancreatic β-Cells

2010· article· en· W2085475144 sur OpenAlexafffund
Ravi N. Vellanki, Liling Zhang, Michelle A. Guney, Jonathan V. Rocheleau, Maureen Gannon, Allen Volchuk

Notice bibliographique

RevueEndocrinology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health Network
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of TorontoNational Institutes of HealthVanderbilt UniversityNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesBanting and Best Diabetes Centre, University of TorontoHeart and Stroke Foundation of CanadaJuvenile Diabetes Research Foundation International
Mots-clésEndoplasmic reticulumExtracellular matrixInternal medicineEndocrinologyGeneUnfolded protein responseExtracellularGene expressionBiologyCell biologyChemistryMedicineBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Old astrocyte specifically induced substance (OASIS) has previously been shown to be a putative endoplasmic reticulum (ER) stress sensor in astrocytes with a mechanism of activation that is similar to ATF6. In this study we investigated the expression and activation of endogenous and overexpressed OASIS in pancreatic beta-cells. OASIS mRNA expression was detected in pancreatic beta-cell lines and rodent islets, and the expression level was up-regulated by ER stress-inducing compounds. Endogenous OASIS protein, however, is expressed at low levels in pancreatic beta-cell lines and rodent islets, possibly due to abundant levels of the micro-RNA miR-140 present in these cells. In contrast, expression of both full-length and cleaved (active) OASIS was readily detectable in the developing mouse pancreas (embryonic d 15.5). Microarray analysis after expression of an active nuclear-localized version of OASIS in an inducible INS-1 beta-cell line resulted in the up-regulation of many genes implicated in extracellular matrix production and protein transport but not classical ER stress response genes. Consistent with this, expression of active OASIS failed to induce glucose-regulated protein 78 kDa promoter activity in pancreatic beta-cells. These results suggest that the repertoire of genes induced by OASIS is cell type-dependent and that the OASIS protein may have a role in pancreas development.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,038
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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