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Enregistrement W2085818415 · doi:10.1101/gad.946501

Chromatin-specific regulation of LEF-1–β-catenin transcription activation and inhibition in vitro

2001· article· en· W2085818415 sur OpenAlexfundno aff
Antonin Tutter, Christy J. Fryer, Katherine A. Jones

Notice bibliographique

RevueGenes & Development · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueWnt/β-catenin signaling in development and cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesUniversity of California, San DiegoNational Institutes of HealthCanadian Institute for Theoretical Astrophysics
Mots-clésTransactivationBiologyChromatinWnt signaling pathwayEnhancerMolecular biologyChromatin remodelingCell biologyTranscription factorTranscription (linguistics)CoactivatorSignal transductionBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Transcriptional activation of Wnt/Wg-responsive genes requires the stabilization and nuclear accumulation of beta-catenin, a dedicated coactivator of LEF/TCF enhancer-binding proteins. Here we report that recombinant beta-catenin strongly enhances binding and transactivation by LEF-1 on chromatin templates in vitro. Interestingly, different LEF-1 isoforms vary in their ability to bind nucleosomal templates in the absence of beta-catenin, owing to N-terminal residues that repress binding to chromatin, but not nonchromatin, templates. Transcriptional activation in vitro requires both the armadillo (ARM) repeats and the C terminus of beta-catenin, whereas the phosphorylated N terminus is inhibitory to transcription. A fragment spanning the C terminus (CT) and ARM repeats 11 and 12 (CT-ARM), but not the CT alone, functions as a dominant negative inhibitor of LEF-1-beta-cat activity in vitro and can block ATP-dependent binding of the complex to chromatin. LEF-1-beta-cat transactivation in vitro was also repressed by inhibitor of beta-catenin and Tcf-4 (ICAT), a physiological inhibitor of Wnt/Wg signaling that interacts with ARM repeats 11 and 12, and by the nonsteroidal anti-inflammatory compound, sulindac. None of these transcription inhibitors (CT-ARM, ICAT, or sulindac) could disrupt the LEF-1-beta-cat complex after it was stably bound to chromatin. We conclude that the CT-ARM region of beta-catenin functions as a chromatin-specific activation domain, and that several inhibitors of the Wnt/Wg pathway directly modulate LEF-1-beta-cat activity on chromatin.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,076
Score d'incertitude au seuil0,554

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations107
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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