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Enregistrement W2085831929 · doi:10.4061/2011/284728

Genetics and Genomics of Late‐Onset Alzheimer′s Disease and Its Endophenotypes

2011· article· en· W2085831929 sur OpenAlexaff
Christiane Reitz, Ekaterina Rogaeva, Tatiana Foroud, Lindsay A. Farrer

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Alzheimer s Disease · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématique14-3-3 protein interactions
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute on AgingMedical Research CouncilWellcome Trust
Mots-clésEndophenotypeGenomicsGeneticsDiseaseBiologyPsychologyMedicineNeuroscienceGenomeCognitionGenePathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Late-onset Alzheimer's disease is the most common cause of dementia in western societies. Despite remarkable achievements in human genetics over the years, in particular, technological advances in gene mapping and in statistical methods, to date only a small proportion of the genetic contribution to Alzheimer's disease can be explained. One reason for the difficulty in gene identification is that Alzheimer's disease is a complex disorder in which multiple genes with small individual effects as well as environmental factors are likely to contribute to disease risk as well as the various quantitative traits associated with the disease such as age-of-onset, cognition, neuropsychiatric symptoms, amyloid/tau pathology, or structural brain changes. Identifying the genetic factors modulating changes in these individual endophenotypes  would help elucidate disease pathogenesis. In this special issue on genetics and genomics of Alzheimer's disease and its endophenotypes, we have invited a few papers that address this issue. The first two articles address the impact of APOE genotype, the best established Alzheimer's disease susceptibility gene, on neuropsychiatric endophenotypes associated with Alzheimer's disease including psychosis, late-life depression, anxiety, apathy, hallucinations, agitation, and aggressiveness. The third paper examines the effect of an intron 7 polymorphism in the amyloid precursor protein (APP)  on the age of onset of Alzheimer's disease in persons with Down syndrome. The fourth and fifth papers explore mechanisms modulating components of the amyloid cascade pathway, focusing, in particular, on the APP intracellular domain (AICD), which is an end product of the proteolytic cleavage of APP by β- and γ-secretase. In the first of these two papers, Ansaloni et al. evaluated the effect of NTRK2  which encodes the TrkB receptor on APP metabolism and AICD levels. TrkB is a member of the tyrosine kinase receptor family and binds specifically to brain-derived neurotrophic factor (BDNF). The paper reports on the effects of different TrkB isoforms on APP metabolism in the human neuroblastoma cell line. In the other paper, Raychaudhuri et al. examined the impact of overexpression of AICD on expression of proteins that are part of pathways involved in neurodegeneration and neuroregeneration. Finally, the sixth paper reviews the findings of genome-wide association studies (GWAS) that tested whether SNPs in the top-ranked Alzheimer's disease-related candidate genes were associated with various brain imaging endophenotypes including the volumes of the temporal lobe, hippocampus, amygdale, and frontal lobe, as well as grey matter density, entorhinal cortex thickness, and white matter integrity. In addition, this article discusses multigene and more complex genetic models as a means to identify genetic contributions to Alzheimer's disease. Christiane Reitz Ekaterina Rogaeva Tatiana Foroud Lindsay A. Farrer

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,184
Score d'incertitude au seuil0,553

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,253 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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