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Enregistrement W2086249877 · doi:10.1111/j.1462-5822.2007.01078.x

Host–pathogen interplay and the evolution of bacterial effectors

2007· review· en· W2086249877 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueCellular Microbiology · 2007
Typereview
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogenic Bacteria Studies
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research Chairs
Mots-clésBiologyVirulencePathogenEffectorHost (biology)Evolutionary biologyPathogenicity islandGeneticsGeneCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Many bacterial pathogens require a type III secretion system (T3SS) and suite of type III secreted effectors (T3SEs) to successfully colonize their hosts, extract nutrients and consequently cause disease. T3SEs, in particular, are key components of the bacterial arsenal, as they function directly inside the host to disrupt or suppress critical components of the defence network. The development of host defence and surveillance systems imposes intense selective pressures on these bacterial virulence factors, resulting in a host-pathogen co-evolutionary arms race. This arms race leaves its genetic signature in the pattern and structure of natural genetic variation found in T3SEs, thereby permitting us to infer the specific evolutionary processes and pressures driving these interactions. In this review, we summarize our current knowledge of T3SS-mediated host-pathogen co-evolution. We examine the evolution of the T3SS and the T3SEs that traverse it, in both plant and animal pathosystems, and discuss the processes that maintain these important pathogenicity determinants within pathogen populations. We go on to examine the possible origins of T3SEs, the mechanisms that give rise to new T3SEs and the processes that underlie their evolution.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,998
Score d'incertitude au seuil0,418

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle