Molecular Markers Linked to Brown Stem Rot Resistance Genes, <i>Rbs<sub>1</sub></i> and <i>Rbs<sub>2</sub></i>, in Soybean
Notice bibliographique
Résumé
Brown stem rot (BSR) of soybean [Glycine max (L.) Merr.] is caused by the fungal pathogen Phialophora gregata (Allington & D.W. Chamberlain) W. Gams and occurs in soybean production areas around the world. Brown stem rot resistance genes Rbs1, Rbs2, and Rbs3 have been identified in soybean germplasm and plant introductions through traditional genetic analyses. Resistance to BSR has been shown to reduce yield losses in soybean, but selection for this trait is laborious and confounded by environmental variation. The objectives of this study were to identify molecular markers linked to BSR resistance genes Rbs1 and Rbs2, and map these genes in the soybean genome. Genetic families of populations segregating for Rbs1 and Rbs2 were evaluated in the greenhouse for BSR phenotypic reaction and identified as resistant, segregating, or susceptible. Leaf tissue collected from members of F2:3 families was bulked and DNA simple sequence repeat (SSR) marker analysis was used to identify markers that cosegregated with BSR reaction phenotypes. Five pairs of Rbs2 near‐isogenic lines were subjected to a similar analysis to verify results obtained from marker analysis conducted on the population segregating for Rbs2 Results of marker analyses indicated that SSR markers Satt215 and Satt431 were linked to Rbs1 and that Satt244 and Satt431 were linked to Rbs2 Marker‐assisted selection in the Rbs1 (using Satt431) and Rbs2 (using Satt244) populations would have correctly predicted 88 and 82%, respectively, of the BSR reaction phenotypes. The Rbs1 and Rbs2 loci map to Molecular Linkage Group J and lie in a region known to contain Rbs3 This region also contains loci conditioning resistance to taxonomically diverse fungal pathogens and a locus affecting nodulation in response to a bacterial symbiont.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».