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Enregistrement W2087172499 · doi:10.2135/cropsci2001.412527x

Molecular Markers Linked to Brown Stem Rot Resistance Genes, <i>Rbs<sub>1</sub></i> and <i>Rbs<sub>2</sub></i>, in Soybean

2001· article· en· W2087172499 sur OpenAlexaff
M. S. Bachman, J. P. Tamulonis, C. D. Nickell, Andrew F. Bent

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSoybean genetics and cultivation
Établissements canadiensMonsanto (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyGermplasmGeneticsGeneQuantitative trait locusPopulationGenetic markerPhenotypic traitMolecular markerMarker-assisted selectionPhenotypePlant disease resistanceStem rotHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Brown stem rot (BSR) of soybean [Glycine max (L.) Merr.] is caused by the fungal pathogen Phialophora gregata (Allington & D.W. Chamberlain) W. Gams and occurs in soybean production areas around the world. Brown stem rot resistance genes Rbs1, Rbs2, and Rbs3 have been identified in soybean germplasm and plant introductions through traditional genetic analyses. Resistance to BSR has been shown to reduce yield losses in soybean, but selection for this trait is laborious and confounded by environmental variation. The objectives of this study were to identify molecular markers linked to BSR resistance genes Rbs1 and Rbs2, and map these genes in the soybean genome. Genetic families of populations segregating for Rbs1 and Rbs2 were evaluated in the greenhouse for BSR phenotypic reaction and identified as resistant, segregating, or susceptible. Leaf tissue collected from members of F2:3 families was bulked and DNA simple sequence repeat (SSR) marker analysis was used to identify markers that cosegregated with BSR reaction phenotypes. Five pairs of Rbs2 near‐isogenic lines were subjected to a similar analysis to verify results obtained from marker analysis conducted on the population segregating for Rbs2 Results of marker analyses indicated that SSR markers Satt215 and Satt431 were linked to Rbs1 and that Satt244 and Satt431 were linked to Rbs2 Marker‐assisted selection in the Rbs1 (using Satt431) and Rbs2 (using Satt244) populations would have correctly predicted 88 and 82%, respectively, of the BSR reaction phenotypes. The Rbs1 and Rbs2 loci map to Molecular Linkage Group J and lie in a region known to contain Rbs3 This region also contains loci conditioning resistance to taxonomically diverse fungal pathogens and a locus affecting nodulation in response to a bacterial symbiont.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations62
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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