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Enregistrement W2087292186 · doi:10.1016/j.jalz.2012.05.2088

P3‐414: Evaluation of a novel caspase‐6 inhibitor as a potential treatment for Alzheimer's disease

2012· article· en· W2087292186 sur OpenAlexaff
Prateep Pakavathkumar, Jan‐Eric Ahlfors, Andréa C. LeBlanc

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s & Dementia · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMachine Learning in Bioinformatics
Établissements canadiensNew World LaboratoriesMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCaspaseCaspase 3Molecular biologyPharmacologyCell cultureApoptosisCaspase-9Recombinant DNABiologyChemistryBiochemistryProgrammed cell deathGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Caspase-6 activity is found abundantly in the neuropil threads, neuritic plaques and neurofibrillary tangles of familial and sporadic forms of Alzheimer disease. Caspase-6 induces axonal degeneration and memory impairment in mice (abstract submitted at this meeting). Therefore, inhibiting Caspase-6 represents a potential treatment for Alzheimer disease. Unfortunately, there are no known natural inhibitors of Caspase-6. In this study, we investigated a newly developed irreversible Caspase-6 inhibitor called NWL-117 developed by New World Laboratories. The toxicity of the Caspase-6 inhibitor was verified on the HCT116 cell line and human primary neurons by MTT, propidium iodide FACS analyses, and Caspase-3 processing by western blots or activity by fluorogenic assays. Dose-dependent inhibition of Caspase-6 was assessed by in vitro fluorogenic assays with purified recombinant active Caspase-6 and on HCT116 cells transfected with a self-activating form of Caspase-6. Inhibition of active Caspase-6 was also assessed in primary human neurons in culture. Caspase-6 activity in cellulo was assessed with FLICA TM -Caspase-6 assays. Specificity of the NWL-117 inhibitor for Caspase-6 was investigated by conducting dose response curves on other purified recombinant caspases by fluorogenic assays. The NWL-117 was not toxic to the HCT116 cells or the neurons at 20 to 100 μM concentrations. In vitro, a dose dependent inhibition of recombinant active Caspase-6 was observed between 50 nM (50%) and 5 μM (100%). NWL-117 was more potent than the peptide inhibitor, Ac-VEID-fmk. A 1 μM concentration of NWL-117 inhibited almost 50% of active Caspase-6 in HCT116 cells and showed a dose-dependent inhibition between 5 μM and 100 μM concentrations. Western blot analyses showed that the Caspase-6 was processed into its active form in the absence or presence of the inhibitor. These results show that NWL-117 is cell permeable and non-toxic at high concentrations. NWL-117 is a potent inhibitor of the processed active form of Caspase-6. Therefore, the NWL-117 can be used to assess if Caspase-6-mediated axonal degeneration can be inhibited and possibly reversed in primary human neurons and mouse brains. If so, this compound is an interesting “lead” compound to develop as an inhibitor of Caspase-6 in Alzheimer disease patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,009

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,041
Tête enseignante GPT0,328
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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