Functional characterization of a promoter polymorphism that drives ACSL5 gene expression in skeletal muscle and associates with diet‐induced weight loss
Notice bibliographique
Résumé
Diet-induced weight loss is affected by a wide range of factors, including genetic variation. Identifying functional polymorphisms will help to elucidate mechanisms that account for variation in dietary metabolism. Previously, we reported a strong association between a common single nucleotide polymorphism (SNP) rs2419621 (C>T) in the promoter of acyl-CoA synthetase long chain 5 (ACSL5), rapid weight loss in obese Caucasian females, and elevated ACSL5 mRNA levels in skeletal muscle biopsies. Here, we showed by electrophoretic mobility shift assay (EMSA) that the T allele creates a functional cis-regulatory E-box element (CANNTG) that is recognized by the myogenic regulatory factor MyoD. The T allele promoted MyoD-dependent activation of a 1089-base pair ACSL5 promoter fragment in nonmuscle CV1 cells. Differentiation of skeletal myoblasts significantly elevated expression of the ACSL5 promoter. The T allele sustained promoter activity 48 h after differentiation, whereas the C allele showed a significant decline. These results reveal a mechanism for elevated transcription of ACSL5 in skeletal muscle of carriers of the rs2419621(T) allele, associated with more rapid diet-induced weight loss. Natural selection favoring promoter polymorphisms that reduced expression of catabolic genes in skeletal muscle likely accounts for the resistance of obese individuals to dietary intervention.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».