A search for diagnostic AFLP markers in <i>Cichorium </i>species with emphasis on endive and chicory cultivar groups
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
The genus Cichorium consists of two widely cultivated species C. intybus (chicory) and C. endivia (endive) and four wild species, C. bottae, C. spinosum, C. calvum, and C. pumilum. A multivariate and an UPGMA (unweighted pair group method average) analysis based on AFLP (amplified fragment length polymorphism) markers were used to establish the genetic relationships among the species and cultivar groups of C. intybus and C. endivia. At the species level, the results correspond with previously obtained phylogenetic relationships in that C. bottae is the most divergent species, and C. intybus and C. spinosum, as well as C. endivia, C. pumilum, and C. calvum formed clusters. Based on the congruence between phylogenetic and genetic analyses, unique markers were expected for all species, however, hardly any specific marker was found except for C. bottae. The analysis of cultivar groups of C. intybus resembled the species analysis in two respects: (i) grouping of cultivars according to cultivar groups, and (ii) lack of markers unique to cultivar groups. In contrast to C. intybus, the cultivar series of C. endivia do not form distinct groups, which would reflect that crosses have been made among the various cultivar groups. The relationships among Cichorium species and cultivars will be useful for setting up a core collection of Cichorium, and stress the importance of inclusion of the wild species in the collection.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle