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Enregistrement W2088077968 · doi:10.1111/j.1472-765x.2004.01469.x

Cloth-based hybridization array system for the detection of multiple antibiotic resistance genes in Salmonella enterica subsp. enterica serotype Typhimurium DT104

2004· article· en· W2088077968 sur OpenAlexaff
Martine Gauthier, B.W. Blais

Notice bibliographique

RevueLetters in Applied Microbiology · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueSalmonella and Campylobacter epidemiology
Établissements canadiensCanadian Food Inspection Agency
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSalmonella entericaAmpliconBiologySalmonellaSerotypeMultiplex polymerase chain reactionPolymerase chain reactionMicrobiologyMultiplexHybridization probeDigoxigeninGeneGeneticsBacteriaIn situ hybridizationGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: A simple DNA macroarray system was developed for detection of antibiotic resistance and other marker genes associated with the multidrug-resistant food pathogen Salmonella enterica subsp. enterica serotype Typhimurium DT104. METHODS AND RESULTS: A multiplex polymerase chain reaction (PCR) incorporating digoxigenin-dUTP was used to simultaneously amplify seven marker sequences, with subsequent rapid detection of the amplicons by hybridization with an array of probes immobilized on polyester cloth and immunoenzymatic assay of the bound label. This system provided sensitive detection of the different genetic markers in the S. Typhimurium DT104 genome, giving positive reactions with as few as 10 CFU, and the hybridizations were highly specific, with no reactions of amplicons with heterologous probes on the array. CONCLUSIONS: This cloth-based hybridization array system (CHAS) provides a simple, cost-effective tool for monitoring S. Typhimurium DT104 in foods and their production environment. SIGNIFICANCE AND IMPACT OF THE STUDY: The CHAS is a simple and cost-effective tool for the simultaneous detection of amplicons generated in a multiplex PCR, and the concept is broadly applicable to the detection and characterization of food pathogens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,046
Score d'incertitude au seuil0,370

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,184 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations13
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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