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Enregistrement W2088322880 · doi:10.1094/pdis-92-6-0974a

First Report of <i>Rubus yellow net virus</i> on <i>Rubus idaeus</i> in Alberta, Canada

2008· article· en· W2088322880 sur OpenAlexaffabout
Melanie Kalischuk, L. M. Kawchuk, F. Leggett

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food CanadaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBlowing a raspberryRubusBiologyGenBankChlorosisPlant virusHorticultureBotanyVirologyVirusGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In North America, Rubus yellow net virus (RYNV), a member of the genus Badnavirus, family Caulimoviridae, is vectored in a semipersistent manner by the large raspberry aphid (Amphorophora agathonica Hottes) and is responsible for producing net-like chlorosis of tissue along the leaf veins (2). Red raspberry (Rubus idaeus L.) is commonly grown in Canada and after the dry, hot summer of 2006 in southern Alberta, a group of garden raspberry plants located near Lethbridge, Alberta exhibited interveinal chlorosis resembling viral symptoms. Nonenveloped, 140 × 30 nm, bacilliform particles typical of badnaviruses were observed in infected leaves by transmission electron microscopy. The presence of RYNV was confirmed by immunocapture of virions from extracts of symptomatic leaves using Sugarcane bacilliform virus polycolonal antiserum (Agdia Incorporated, Elkhart, IN) followed by PCR amplification of a 451-bp fragment with RYNV-specific primers based on the highly conserved region of the reverse transcriptase and ribonuclease H genes (5'-ATCCTCAAAGGGTTACGTAGCTGGTT-3' and 5'-TTCAAGCCACCTTACCCTCGAAGGTTT-3'). Sequence of clones from the PCR product (GenBank Accession No. EU327346) showed 87% identity to a previously sequenced isolate of RYNV (GenBank Accession No. AF468454) (1). To our knowledge, this is the first report of RYNV in Alberta, Canada, and as an important component of raspberry veinbanding disease, it poses a new threat to the Alberta raspberry industry. References: (1) A. T. Jones et al. Ann. Appl. Biol. 141:1, 2002. (2) R. Stace-Smith. Can. J. Bot. 33:269, 1955.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,309
Score d'incertitude au seuil0,332

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,186 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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