First Report of <i>Rubus yellow net virus</i> on <i>Rubus idaeus</i> in Alberta, Canada
Notice bibliographique
Résumé
In North America, Rubus yellow net virus (RYNV), a member of the genus Badnavirus, family Caulimoviridae, is vectored in a semipersistent manner by the large raspberry aphid (Amphorophora agathonica Hottes) and is responsible for producing net-like chlorosis of tissue along the leaf veins (2). Red raspberry (Rubus idaeus L.) is commonly grown in Canada and after the dry, hot summer of 2006 in southern Alberta, a group of garden raspberry plants located near Lethbridge, Alberta exhibited interveinal chlorosis resembling viral symptoms. Nonenveloped, 140 × 30 nm, bacilliform particles typical of badnaviruses were observed in infected leaves by transmission electron microscopy. The presence of RYNV was confirmed by immunocapture of virions from extracts of symptomatic leaves using Sugarcane bacilliform virus polycolonal antiserum (Agdia Incorporated, Elkhart, IN) followed by PCR amplification of a 451-bp fragment with RYNV-specific primers based on the highly conserved region of the reverse transcriptase and ribonuclease H genes (5'-ATCCTCAAAGGGTTACGTAGCTGGTT-3' and 5'-TTCAAGCCACCTTACCCTCGAAGGTTT-3'). Sequence of clones from the PCR product (GenBank Accession No. EU327346) showed 87% identity to a previously sequenced isolate of RYNV (GenBank Accession No. AF468454) (1). To our knowledge, this is the first report of RYNV in Alberta, Canada, and as an important component of raspberry veinbanding disease, it poses a new threat to the Alberta raspberry industry. References: (1) A. T. Jones et al. Ann. Appl. Biol. 141:1, 2002. (2) R. Stace-Smith. Can. J. Bot. 33:269, 1955.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».