Detection and molecular characterisation of bovine polyomavirus in bovine sera in New Zealand
Notice bibliographique
Résumé
AIM: To investigate the prevalence of bovine polyomavirus (BPyV) DNA in commercial batches of bovine serum products, cell lines and cattle in New Zealand and to characterise the viral DNA detected. METHODS: Two nested polymerase chain reaction (PCR) assays were applied to detect BPyV in bovine sera. One was used to screen for the VP1 gene of BPyV DNA in: 140 batches of commercial bovine serum products, including 66 batches of fetal bovine serum (FBS), 34 batches of calf serum, and 40 batches of adult bovine serum (ABS)/plasma; 112 individual adult bovine sera; and 16 cell lines of various species origin. Fifty batches of serum samples were also tested, using the second nested PCR assay that screened for the Large T gene. Restriction fragment length polymorphism (RFLP) was conducted with 36 PCR products amplified from the VP1 gene of BPyV using EcoRI. Five selected VP1 PCR products were subjected to DNA sequencing and phylogenetic analysis. RESULTS: BPyV DNA was detected in 46 (70%) batches of FBS, 11 (32%) batches of calf sera and two (5%) batches of ABS/plasma, an overall prevalence of 42%. None of 112 adult bovine sera was BPyV-positive. RFLP analysis demonstrated a uniform digestion pattern in the majority (31/36) of amplicons tested, while the remaining PCR amplicons did not show enzyme cleavage. Sequence analysis of the PCR products (a 263 base pair (bp) fragment of the VP1 gene) obtained from five batches of FBS showed 96.2-98.9% homology to that of published sequences of BPyV. CONCLUSION: BPyV is a frequent contaminant of commercial bovine serum in New Zealand. The incidence of BPyV in adult bovine serum products is much lower than in FBS and calf serum. Genomic variations exist among different viruses. The clinical significance of the high prevalence of BPyV DNA in bovine serum products is yet to be determined.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».