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Enregistrement W2088379564 · doi:10.1134/s0006350913030135

3-Dimensional microscopy as a method for volume measurement in cells undergoing apoptosis

2013· article· en· W2088379564 sur OpenAlexaff
А. А. Platonova, С. В. Кольцова, Г. В. Максимов, R. Grygorszyk, Sergei N. Orlov

Notice bibliographique

RevueBIOPHYSICS · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell death mechanisms and regulation
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStaurosporineApoptosisProgrammed cell deathCell biologyCellNecrosisChemistryBiophysicsBiologyPathologyMedicineBiochemistrySignal transductionProtein kinase C

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Different patterns of cell volume perturbations are commonly used for modes of cell death: necrosis (cell swelling) and apoptosis (cell shrinkage). In this study we employed recently developed three dimensional microscopy for the measurement of the volume of attached vascular smooth muscle cells transfected with E1A-adenoviral protein. These cells undergo rapid apoptosis in the absence of growth factors or in the presence of staurosporine. In 30-60 min of serum deprivation the volume of these cells is increased by -40% that corresponds to the time point of maximal activation of caspase 3 and chromatin cleavage. In 10-15 min swollen cells exhibit morphological collapse indicated by formation of apoptotic bodies. In contrast to serum-deprived cells, staurosporine leads to attenuation of cell volume by 30%. In this case, apoptotic bodies are detected in -2.5 hr after maximal shrinkage. Thus, our results show that cell shrinkage can not be considered as universal hallmark of apoptosis. The role of stimulus-specific cell volume perturbation in the triggering of the cell death machinery should be examined further.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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