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Enregistrement W2088509045 · doi:10.1159/000345203

The Genetics of Susceptibility to Variant Creutzfeldt-Jakob Disease

2013· review· en· W2088509045 sur OpenAlexaff
Reuben Saba, Stephanie A. Booth

Notice bibliographique

RevuePublic Health Genomics · 2013
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensPublic Health Agency of Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBovine spongiform encephalopathyPRNPDiseaseIncubation periodGenotypeGenetic predispositionBiologyInfectious agentTransmissible spongiform encephalopathyPopulationGeneticsVirologyMedicinePrion proteinGeneEnvironmental healthScrapieIncubationPathology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The emergence of bovine spongiform encephalopathy (BSE) in cattle and, subsequently, its transmission to humans resulting in variant Creutzfeldt-Jakob disease (vCJD) in the UK has proved to be one of the major public health scares of the century. The oral route of infection, the long incubation period, and the incredible resistance of the transmissible infectious agent to various forms of decontamination poses unique challenges. Fortunately, despite extensive exposure of the UK population to contaminated meat, the size of the vCJD epidemic that has emerged since its initial detection is relatively low (225 worldwide). An explanation for this disparity is as yet incomplete, but the development of the disease is likely influenced by a number of factors including physical properties of the infectious agent, environmental factors such as the route and amount of exposure and individual susceptibility factors. This review focuses on current knowledge of the genetic factors that undoubtedly play a major role in influencing the development of vCJD. In terms of genetic susceptibility, the best characterised is the common single nucleotide polymorphism at codon 129 of the human prion protein gene (PRNP). Moreover, several other polymorphisms and mutations have been identified that may affect susceptibility as well as other important disease characteristics such as the highly variable prion disease incubation period.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,082
Tête enseignante GPT0,364
Écart entre enseignants0,282 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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