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Enregistrement W2088678949 · doi:10.1021/bi0119161

Pentavalent Ions Dependency Is a Conserved Property of Adenosine Kinase from Diverse Sources:  Identification of a Novel Motif Implicated in Phosphate and Magnesium Ion Binding and Substrate Inhibition

2002· article· en· W2088678949 sur OpenAlexafffund
Mary C. Maj, Bhag Singh, Radhey S. Gupta

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueBiochemical and Molecular Research
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesUniversity of British ColumbiaMcMaster University
Mots-clésAdenosineBiochemistryMutantAdenosine kinaseChemistryKinaseAdenosine triphosphateBinding siteBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The catalytic activity of adenosine kinase (AK) from mammalian sources has previously been shown to exhibit a marked dependency upon the presence of pentavalent ions (PVI), such as phosphate (PO4), arsenate, or vanadate. We now show that the activity of AK from diverse sources, including plant, yeast, and protist species, is also markedly enhanced in the presence of PVI. In all cases, PO4 or other PVI exerted their effects primarily by decreasing the Km for adenosine and alleviating the inhibition caused by high concentrations of substrates. These results provide evidence that PVI dependency is a conserved property of AK and perhaps of the PfkB family of carbohydrate kinases which includes AK. On the basis of sequence alignments, we have identified a conserved motif NXXE within the PfkB family. The N and E of this motif make close contacts with Mg2+ and PO4 ions in the crystal structures of AK and bacterial ribokinase (another PfkB member which shows PVI dependency), implicating these residues in their binding. Site-directed mutagenesis of these residues in Chinese hamster AK have resulted in active proteins with greatly altered phosphate stimulation and substrate inhibition characteristics. The N239Q mutation leads to the formation of an active protein whose activity was not stimulated by PO4 or inhibited by high concentrations of adenosine or ATP. The activity of the E242D mutant protein was also not significantly altered in the presence of phosphate. Although PO4 had no effect on the KmAdenosine for this mutant, the KmATP, K(i)Adenosine, and K(i)ATP were significantly decreased. In contrast to these mutations, N239L or E242L mutant proteins showed greatly decreased activity with an altered Mg2+ requirement. These observations support the view that N239 and E242 play an important role in the binding of PO4 and Mg2+ ions required for the catalytic activity of adenosine kinase.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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