Progress in the Genetics of Primary Biliary Cirrhosis
Notice bibliographique
Résumé
Primary biliary cirrhosis (PBC) is a chronic cholestatic liver disease that has a prevalence of 1 in 1000 women over the age of 40. Treatment is presently limited to ursodeoxycholic acid, a hydrophilic bile acid that has nonspecific, choleretic, effects in cholestatic liver disease. PBC has strong autoimmune features, including highly specific loss of tolerance to a ubiquitous mitochondrial antigen. Both environmental and genetic factors are considered important in the pathogenesis of disease. Prior to the advent of genome-wide association studies, only class II human leucocyte antigen (HLA) loci (HLA-DRB1*08, *11, and *13) had been reproducibly shown to associate with disease. Non-HLA loci were suggested for several genes (e.g., CTLA-4, MDR3), but often inconclusively replicated. With the application of genome-wide technology, HLA was confirmed as the strongest association and many other risk loci have been identified, with equivalent effect size to HLA, including IL12A, IL12RB2, STAT4, IRF5-TNPO3, 17q12.21, MMEL1, SPIB, and CTLA-4. These collectively support an important role for innate and adaptive immunity in development of disease. Further insights are predicted as studies with larger cohorts are assembled, and different approaches are taken to further discover common and uncommon gene variants associated with disease. Disease subphenotypes such as response to therapy, clinical progression, and symptoms remain additional areas for further dedicated studies, and in which different genetic risk factors may be relevant. Identification of risk loci associated with disease has the potential to aid development of rational, disease-specific, therapies in the future.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,003 |
| Communication savante | 0,002 | 0,002 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».