Salmonella enterica serovar Typhimurium effector SigD/SopB is membrane-associated and ubiquitinated inside host cells
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
SigD/SopB is an effector protein translocated into host cells by one of the type III secretion systems of Salmonella enterica serovar Typhimurium (serovar Typhimurium). It is an inositol phosphatase that has activity towards several inositol phospholipids in vitro, including phosphatidylinositol 3,4,5- triphosphate. SigD activates Akt in epithelial cells and indirectly activates Cdc42 through one of its products, inositol 1,4,5,6-tetrakisphosphate. As phospholipid targets of SigD activity are localized to host cell membranes, we sought to investigate the intracellular localization of translocated SigD. We show here that SigD is a membrane-associated protein that is ubiquitinated inside host cells. SigD was extracted from host cell membranes with a high pH buffer but not by high salt. Fractionation and deletion analysis using transfected SigD-green fluorescent protein fusions revealed that amino acid residues 117-167 of SigD are essential for membrane association, and that a fragment containing residues 29-116 was ubiquitinated. This is the first direct evidence of a bacterial effector protein being ubiquitinated. Treatment of cells with the proteasome inhibitor MG-132 revealed that, unlike the host cell protein inhibitor of nuclear factor kappa B (IkappaBalpha), SigD does not appear to be rapidly degraded by the proteasome. We speculate that ubiquitination serves to downregulate SigD activity by an alternative mechanism, such as by targeting it for lysosomal degradation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle