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Enregistrement W2089225284 · doi:10.1021/bi800402q

Trafficking and Intracellular ATPase Activity of Human Ecto-nucleotidase NTPDase3 and the Effect of ER-Targeted NTPDase3 on Protein Folding

2008· article· en· W2089225284 sur OpenAlexafffund
Vasily V. Ivanenkov, Jean Sévigny, Terence L. Kirley

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdenosine and Purinergic Signaling
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Heart, Lung, and Blood InstituteUniversität HeidelbergJohns Hopkins University
Mots-clésEndoplasmic reticulumGolgi apparatusBrefeldin ACell biologySecretory pathwayATP hydrolysisBiochemistryBiologyER retentionChemistryATPaseMutantEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ecto-nucleoside triphosphate diphosphohydrolases, NTPDase1 (CD39) and NTPDase3, are integral plasma membrane proteins that hydrolyze extracellular nucleotides, thereby modulating the function of purinergic receptors. During processing in the secretory pathway, the active sites of ecto-nucleotidases are located in the lumen of vesicular compartments, thus raising the question whether the ecto-nucleotidases affect the ATP-dependent processes in these compartments, including protein folding in the endoplasmic reticulum (ER). It has been reported (J. Biol. Chem. (2001) 276, 41518-41525) that CD39 is not active until it reaches the plasma membrane, suggesting that terminal glycosylation in Golgi is critical for its activity. To investigate the subcellular location and the mechanism of ecto-nucleotidase activation, we expressed human NTPDase3 in COS-1 cells and blocked the secretory transport with monensin or brefeldin A, or by targeting to ER with a signal peptide. Cell surface biotinylation, sensitivity to glycosidases, and fluorescence microscopy analyses suggest that, in contrast to the previous report on CD39, NTPDase3 becomes catalytically active in the ER or in the ER-Golgi intermediate compartment, and that terminal glycosylation in Golgi is not essential for activity. Moreover, ER-targeted NTPDase3, but not wild-type NTPDase3 or ER-targeted inactive G221A mutant, significantly diminished the folding efficiency and the transport to the plasma membrane of coexpressed CD39 used as a reporter protein. These data suggest that ER-targeted NTPDase3 significantly depletes ATP in ER, whereas wild-type NTPDase3 is likely to acquire ATPase activity in a post-ER, but pre-Golgi, compartment, thus avoiding unproductive ATP hydrolysis and interference with protein folding in the ER. ER-targeted NTPDase3 may be a useful experimental tool to study the effects of ER ATP depletion on ER function under normal and stress conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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