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Enregistrement W2089446402 · doi:10.1212/wnl.0b013e3181e475b7

Separating the wheat from the chaff

2010· letter· en· W2089446402 sur OpenAlexaff
Joachim M. Baehring, J. Gregory Cairncross

Notice bibliographique

RevueNeurology · 2010
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGlioma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIDH1Isocitrate dehydrogenaseBiomarkerOncologyMedicinePathologyBiologyBioinformaticsMutationGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Biomarkers are en vogue. Although few ever prove to be of practical value or find their place in routine clinical testing, occasionally a biomarker of great importance is identified, a biomarker that tells us something fundamental about a disease or points us to a specific therapeutic intervention. One such biomarker in neurooncology is the codeletion of chromosomal arms 1p and 19q in oligodendrogliomas, which is highly associated with classic histopathology, and as such has aided diagnosis, and, importantly, identifies a type of brain cancer that grows slowly and responds to treatment. The recent discovery of a somatic mutation in isocitrate dehydrogenase genes (IDH) in infiltrative gliomas likewise stands out, predicting a favorable clinical outcome and shedding light on the molecular pathogenesis of these neoplasms. In this issue of Neurology ®, Labussiere et al.1 make the remarkable observation that 1p and 19q allelic loss is invariably associated with IDH mutations. In a cohort of 764 gliomas, those with codeletion of chromosome 1p and 19q had mutations of either IDH1 (92%) or IDH2 (8%), whereas only one third of tumors with variable partial deletions of 1p and 19q, …

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,005
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,025
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Commentaire · Signal consensuel: Commentaire
Score de désaccord entre enseignants0,023
Score d'incertitude au seuil0,026

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0050,025
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0030,008
Communication savante0,0050,016
Science ouverte0,0010,003
Intégrité de la recherche0,0230,038
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0070,007

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,264
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreCommentaire

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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