MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2090394104 · doi:10.1371/journal.pone.0070556

A Computational Exploration of the Interactions of the Green Tea Polyphenol (–)-Epigallocatechin 3-Gallate with Cardiac Muscle Troponin C

2013· article· en· W2090394104 sur OpenAlexfundno aff
Dominic Botten, Giorgia Fugallo, Franca Fraternali, Carla Molteni

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTea Polyphenols and Effects
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesEngineering and Physical Sciences Research CouncilUniversity of EdinburghImperial College LondonOffice of ScienceKing's College LondonUniversity of Alberta
Mots-clésTroponin ITroponin CPolyphenolTroponinBiophysicsEpigallocatechin gallateChemistryBiochemistryBiologyMedicineCardiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Thanks to its polyphenols and phytochemicals, green tea is believed to have a number of health benefits, including protecting from heart disease, but its mechanism of action at the molecular level is still not understood. Here we explore, by means of atomistic simulations, how the most abundant of the green tea polyphenols, (-)-Epigallocatechin 3-Gallate (EGCg), interacts with the structural C terminal domain of cardiac muscle troponin C (cCTnC), a calcium binding protein that plays an important role in heart contractions. We find that EGCg favourably binds to the hydrophobic cleft of cCTnC consistently with solution NMR experiments. It also binds to cCTnC in the presence of the anchoring region of troponin I (cTnI(34-71)) at the interface between the E and H helices. This appears to affect the strength of the interaction between cCTnC and cTnI(34-71) and also counter-acts the effects of the Gly159Asp mutation, related to dilated cardiomyopathy. Our simulations support the picture that EGCg interacting with the C terminal domain of troponin C may help in regulating the calcium signalling either through competitive binding with the anchoring domain of cTnI or by affecting the interaction between cCTnC and cTnI(34-71).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,778
Score d'incertitude au seuil0,217

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePLoS ONEMême sujetTea Polyphenols and EffectsTravaux en français237 207