Structure of a group III truncated hemoglobin from<i>Camphylobacter jejuni</i>
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Truncated hemoglobins (trHbs) build a protein family loosely related to hemoglobin, showing smaller size and extensive residue substitutions relative to conventional Hbs (< 20% sequence identity).TrHbs, widespread in unicellular organisms and in some plants, bind oxygen, and display diversified functions, including NO-detoxification.The trHb family is divided in three groups, based on amino acid sequences and evolutionary considerations.We have shown in the past that trHbs from group I and II adopt a 2-on-2 alpha-helical sandwich fold, hosting the heme [1].Moreover, a protein matrix tunnel connecting the heme to the protein surface has been identified [2].Here we present the first crystal structure of a group III trHb (from Camphylobacter jejuni, a micro-aerobic prokaryote parasite; data at 2.5 resolution, R-gen 21.9%, R-free 26.6%).We show that the trHb fold is modified mostly at the N-terminus, at the C-CD helical region, and in the matrix tunnel, that is closed and filled by core residues in this protein.We present these results at the light of evolution of the trHb and globin folds, and of the two protein families.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle