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Enregistrement W2090870468 · doi:10.1186/1753-6561-5-s1-p39

Evaluation of deletion of nuclease genes cluster in L. major

2011· article· en· W2090870468 sur OpenAlexaff
Noushin Davoudi, Maryam Hejazi, Zahra Khodayari, Robert McMaster

Notice bibliographique

RevueBMC Proceedings · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTrypanosoma species research and implications
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNucleaseGeneBiologyGeneticsPurineHomologous recombinationEnzymeBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The nuclease is a surface enzyme unique to trypanosomatid parasites. These organisms lack the pathway for de novo purine biosynthesis and thus are entirely dependent upon their hosts to supply this nutrient for their survival, growth, and multiplication. There is a cluster on chromosome 30 which carries 2 copy of nuclease genes and 5 identical nuclease like proteins in L. major which are in cis form with 700-800 bp intergenic regions which have more than 80% homology. These data shows that this enzyme might play an important role in facilitating the survival, growth, and development of this important human pathogen. In previous studies, have been shown that L. major 3′NT/NU which is expressed specifically in promastigotes is not the key molecules involved in host purine salvaging pathway and thus in better understanding parasite strategies adopted to survive in sandflies. Therefore, only deletion of nuclease genes followed by sandfly infections experiments will allow determining its precise role in purine salvaging and sandfly infection and specificity. We have developed nuclease cluster heterozygote and homozygote knockout mutants, with homologous recombination technique, to evaluate deletion effects on survival of parasite and infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,703
Score d'incertitude au seuil0,357

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,130
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,214 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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