Microarray and Biochemical Analysis of Lovastatin-induced Apoptosis of Squamous Cell Carcinomas
Notice bibliographique
Résumé
We recently identified 3-hydroxy-3-methylglutaryl coenzyme A (HMG-CoA) reductase, the rate-limiting enzyme of the mevalonate pathway, as a potential therapeutic target of the head and neck squamous cell carcinomas (HNSCC) and cervical carcinomas (CC). The products of this complex biochemical pathway, including de novo cholesterol, are vital for a variety of key cellular functions affecting membrane integrity, cell signaling, protein synthesis, and cell cycle progression. Lovastatin, a specific inhibitor of HMG-CoA reductase, induces a pronounced apoptotic response in a specific subset of tumor types, including HNSCC and CC. The mediators of this response are not well established. Identification of differentially expressed genes represents a feasible approach to delineate these mediators as lovastatin has the potential to modulate transcription indirectly by perturbing levels of sterols and other mevalonate metabolites. Expression analysis following treatment of the HNSCC cell lines SCC9 or SCC25 with 10 microM lovastatin for 1 day showed that less than 2% (9 cDNAs) of the 588 cDNAs on this microarray were affected in both cell lines. These included diazepam-binding inhibitor/acyl-CoA-binding protein, the activated transcription factor 4 and rhoA. Because the biosynthesis of mevalonate leads to its incorporation into more than a dozen classes of end products, their role in lovastatin-induced apoptosis was also evaluated. Addition of the metabolites of all the major branches of the mevalonate pathway indicated that only the nonsterol moiety, geranylgeranyl pyrophosphate (GGPP), significantly inhibited the apoptotic effects of lovastatin in HNSCC and CC cells. Because rhoA requires GGPP for its function, this links the microarray and biochemical data and identifies rhoA as a potential mediator of the anticancer properties of lovastatin. Our data suggest that the depletion of nonsterol mevalonate metabolites, particularly GGPP, can be potential mediators of lovastatin-induced apoptosis of HNSCC and CC cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».