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Enregistrement W2092209874 · doi:10.1136/jmg.40.6.418

A new genetic locus for X linked progressive cone-rod dystrophy

2003· article· en· W2092209874 sur OpenAlexaff
Reetta Jalkanen

Notice bibliographique

RevueJournal of Medical Genetics · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Eye InstituteNational Institutes of HealthResearch to Prevent Blindness
Mots-clésLocus (genetics)GeneticsBiologyGenetic linkageRetinitis pigmentosaGenetic heterogeneityExonGene mappingGenetic markerGenePhenotypeChromosome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

X linked progressive cone-rod dystrophy (COD) is a retinal disease primarily affecting the cone photoreceptors. The disease is genetically heterogeneous and two loci, COD1 (Xp21.1-11.4) and COD2 (Xq27.2-28), have been previously identified. COD1 was recently shown to be caused by mutations in RPGR exon ORF15 (Xp21.1), the gene that is also responsible for RP3 type retinitis pigmentosa. In this study, we performed a linkage study to map the disease gene in a large Finnish family with X linked cone-rod dystrophy, using a panel of 39 X chromosomal markers. Several recombinations between the disease gene and markers in the Xp21.1-p11.4 region have excluded COD1 as a candidate locus in this family. Consistent with the linkage results, no mutation was detected by direct PCR sequencing of the coding region of RPGR, including exon ORF15. The COD2 locus has been also excluded as the site of the gene on the basis of negative lod score values obtained for COD2 linked markers. The disease causing gene of the studied COD family has been localised between the markers DXS10042 and DXS8060 on Xp11.4-q13.1. Positive pairwise lod scores >3 were obtained for markers DXS993, MAOB, DXS1055, and DXS1194. Since this locus is distinct from the previously identified two loci, COD1 and COD2, our results establish a new third genetic locus for X linked progressive cone-rod dystrophy and further expands our knowledge about the genetic heterogeneity underlying this disease entity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,580
Score d'incertitude au seuil0,522

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,279
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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