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Enregistrement W2092469155 · doi:10.1021/bi100378m

Probing the “Charge Cluster Mechanism” in Amphipathic Helical Cationic Antimicrobial Peptides

2010· article· en· W2092469155 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensHealth Sciences CentreMcMaster University Medical Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMagaininAntimicrobial peptidesAmphiphileChemistryCationic polymerizationPeptideAntimicrobialBiochemistryMembrane lipidsMembraneCombinatorial chemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clustering of anionic lipids away from zwitterionic ones by cationic antimicrobial agents has recently been established as a mechanism of action of natural small, flexible peptides as well as non-natural synthetic peptide mimics. One of the largest classes of antimicrobial peptides consists of peptides that form cationic amphipathic helices on membranes and whose toxic action is dependent on the formation of pores in the membrane or through the "carpet" mechanism. We have evaluated the role of anionic lipid clustering for five of these peptides, i.e., MSI-78, MSI-103, MSI-469, MSI-843, and MSI-1254, with different sequences and properties. We determined whether these amphipathic helical cationic antimicrobial peptides cluster anionic lipids from zwitterionic ones and if this property is related to the species specificity of their toxicity. All five of these peptides were capable of lipid clustering, in contrast to the well-studied amphipathic helical antimicrobial peptide, magainin 2, which does not. We ascribe this difference to the lower density of positive charges in magainin 2. Peptides that efficiently cluster anionic lipids generally have a ratio of MIC for Staphylococcus aureus to that for Escherichia coli of >1. The addition of an N-terminal octyl chain did not preclude anionic charge clustering, although the ratio of MIC for S. aureus to that for E. coli was somewhat lowered. In most Gram-positive bacteria, there is a predominance of anionic lipids in the cytoplasmic membrane. In Gram-negative bacteria, however, clustering of anionic lipids away from zwitterionic ones is emerging as an important contributing mechanism of bacterial toxicity for some antimicrobial agents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,611

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle