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Enregistrement W2092495734 · doi:10.1139/b01-144

Architectural and genotypic variation in the clonal shrub <i>Taxus canadensis</i> as determined from random amplified polymorphic DNA and amplified fragment length polymorphism

2002· article· en· W2092495734 sur OpenAlexfundvenueaboutno aff
Claude Édelin, Anne Bruneau, André Bouchard

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant and animal studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésAmplified fragment length polymorphismBiologyRAPDGenotypeGenetic variationGeneticsBotanyPopulationAnalysis of molecular varianceDNA profilingEvolutionary biologyGenetic structureDNAGenetic diversityGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Canada yew (Taxus canadensis Marsh.) is a clonal species with two types of ramets. The most common type has bilateral symmetry and alternate branching. The radial symmetry and opposite branching of the rarer type are similar to the architecture expressed in a young plant grown from seed. Architectural analysis was conducted on four colonies of increasing age and size. A genetic analysis using random amplified polymorphic DNA (RAPD) and amplified fragment length polymorphism (AFLP) was conducted on 122 ramets, 93 sampled from nine colonies from a single population, 24 from eight other populations, and five from other Taxus species. Analysis of the architectural development sequence shows that yew follows the same architectural model as, for example, species of Abies or Picea. This model constitutes a level of organization intermediate between that of the ramet and of the genet. The molecular analyses confirm the greater variability of AFLPs over RAPDs and indicate that architecture is not directly related to genotypic variation. Ramets with radial symmetry have slightly higher genetic variation, on average, than ramets with bilateral symmetry with 95% degree of confidence. The molecular analyses show that the level of resolution of the AFLPs is adequate to characterize 98% of the ramets of a colony. Between pairs of physically connected ramets, some random genotypic differences are observed, supporting the hypothesis of genetic mosaicism in plants, due to somaclonal variations.Key words: architecture, clonal plant, intraclonal variation, molecular markers, somaclonal mutations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,046
Score d'incertitude au seuil0,091

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,176
Écart entre enseignants0,149 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2002
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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