Architectural and genotypic variation in the clonal shrub <i>Taxus canadensis</i> as determined from random amplified polymorphic DNA and amplified fragment length polymorphism
Notice bibliographique
Résumé
Canada yew (Taxus canadensis Marsh.) is a clonal species with two types of ramets. The most common type has bilateral symmetry and alternate branching. The radial symmetry and opposite branching of the rarer type are similar to the architecture expressed in a young plant grown from seed. Architectural analysis was conducted on four colonies of increasing age and size. A genetic analysis using random amplified polymorphic DNA (RAPD) and amplified fragment length polymorphism (AFLP) was conducted on 122 ramets, 93 sampled from nine colonies from a single population, 24 from eight other populations, and five from other Taxus species. Analysis of the architectural development sequence shows that yew follows the same architectural model as, for example, species of Abies or Picea. This model constitutes a level of organization intermediate between that of the ramet and of the genet. The molecular analyses confirm the greater variability of AFLPs over RAPDs and indicate that architecture is not directly related to genotypic variation. Ramets with radial symmetry have slightly higher genetic variation, on average, than ramets with bilateral symmetry with 95% degree of confidence. The molecular analyses show that the level of resolution of the AFLPs is adequate to characterize 98% of the ramets of a colony. Between pairs of physically connected ramets, some random genotypic differences are observed, supporting the hypothesis of genetic mosaicism in plants, due to somaclonal variations.Key words: architecture, clonal plant, intraclonal variation, molecular markers, somaclonal mutations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».