Structures, Functions, and Interactions of ClpT1 and ClpT2 in the Clp Protease System of Arabidopsis Chloroplasts
Notice bibliographique
Résumé
Plastid ClpT1 and ClpT2 are plant-specific proteins that associate with the ClpPR protease. However, their physiological significance and structures are not understood. Arabidopsis thaliana loss-of-function single clpt1 and clpt2 mutants showed no visible phenotypes, whereas clpt1 clpt2 double mutants showed delayed development, reduced plant growth, and virescent, serrated leaves but were viable and produced seed. The clpt1 and clpt1 clpt2 mutants showed partial destabilization of the ClpPR complex, whereas clpt2 null mutants showed only marginal destabilization. Comparative proteomics of clpt1 clpt2 plants showed a proteostasis phenotype similar to viable mutants in ClpPR core subunits, indicating reduced Clp protease capacity. In vivo and in vitro assays showed that ClpT1 and ClpT2 can independently interact with the single ClpP ring and ClpPR core, but not with the single ClpR ring. We determined ClpT1 and ClpT2 structures (2.4- and 2.0-Å resolution) and detailed the similarities to the N-domains of bacterial ClpA/C chaperones. The ClpT structures suggested a conserved MYFF motif for interaction with the ClpPR core near the interface between the P- and R-rings. In vivo complementation showed that ClpT function and ClpPR core stabilization require the MYFF motif. Several models are presented that may explain how ClpT1,2 contribute to ClpPR protease activity.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».